计算化学公社

标题: 第八届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！ [打印本页]

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Author: sobereva 时间: 2021-1-24 22:14
标题: 第八届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！

第八届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！

2021年1月24日

北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）连同北京科韵科技发展中心于2021年1月18日至21日在北京冠京饭店成功举办了“第八届北京科音分子动力学与GROMACS培训班”，本培训由北京科音自然科学研究中心主任卢天讲授。从2015年起，北京科音已举办了34期质量很高且费用良心的计算化学培训，在我国计算化学领域内获得了非常好的口碑和很高的关注度，累计参加人数超过4000人，在中国的青年计算化学研究者中大约平均每10个人就有1人参加过，培训的回顾和学员发表的感想可参见http://bbs.keinsci.com/forum-43-1.html。本次“第八届北京科音分子动力学与GROMACS培训班”的报名情况同北京科音举办的历届培训一样火爆，培训正式通知于2020年12月10日中午12点整在北京科音官网、非常知名的计算化学论坛“计算化学公社”（http://bbs.keinsci.com）和非常活跃、十分专业的共6000人的计算化学QQ交流群“思想家公社”(18616395、466017436)发布后，约5分钟便已报满而截止了报名！

参加本次培训的学员共174人。由于近期部分地区疫情复燃，导致多半学员出行受到严重限制。本次培训实际到场74多人，其它100名学员通过邮寄的印有培训用的全部1500页ppt的讲义+听全程现场录音+补充视频（对应“第五天”的课程）+线上答疑方式学习。值得一提的是，COVID-19疫情完全没有对本次培训的现场举办造成任何不良影响，而且为了保证培训期间学员健康的绝对安全，在培训过程中我们要求所有学员全程佩戴口罩，只接受低风险地区的学员到现场参加。而且我们还特意使用了非常大的场地，使得每位学员都有独立的桌子、彼此间有1.5米的安全距离。

本次学员来自全国各地高校，如清华、北大、上交大、浙大、中科大、西安交大、南开、川大、北师大、北科大、人大、吉大、中山、厦大、国科大、武大、北航、哈工大，等等；也有很多来自研究院所，如中科院化学所/生态环境研究中心/长春应化所/新疆理化所/青岛生物能源与过程研究所/青海盐湖研究所/深圳先进技术研究院。还有大陆以外的单位的学员参加，他们来自加利福尼亚大学戴维斯分校、东京大学、澳门大学中华医药研究院、阿卜杜拉国王科技大学、香港科技大学。另外，也有少量学员来自与生物、药物、材料有关的企业单位。

本培训和往届一样十分顺利地举办并再次获得了圆满成功，在一片热烈的掌声中圆满结束。本培训在开始前就由于细致的准备获得了学员们在QQ群中的充分肯定，在结束后又得到了学员们的广泛好评和赞扬：

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北京科音的培训一直以来都以信息量极大、信息密度极高而著称。本届四天共32课时的培训安排得十分紧凑，内容丰富，强度非常大，每天上午3个小时+下午5个小时的课程中连一次课间休息时间都没有。由于培训的信息量实在太大导致在4天的现场培训中不可能全讲完，因此我们还向学员提供了8个多小时的补充视频讲解其余内容，相当于“第5天”的课程。

本次培训中由讲授者卢老师精心制作的幻灯片总量多达1500页。虽然培训发给了学员印有所有这些幻灯片的讲义，而且幻灯片上的内容非常详细，在课上卢老师还即兴添加了很多额外内容，争取令学员能学到更多，并且尽力把幻灯片上的内容解释得易于理解。

紧密的四天的现场培训结束后的第二天一早，卢老师不顾休息，紧接着就在培训专门的QQ群里花了很多时间详细耐心地解答了学员们在听课中产生的各种疑问以及平时研究当中遇到的各种问题：

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本次培训的专用QQ群在培训结束后的半个月后解散，然而在培训群解散后，学员们的问题还会由讲授者卢老师继续在计算化学公社论坛（http://bbs.keinsci.com）和专门讨论计算化学的6000人的思想家公社QQ群中进行的无限期的义务解答。

北京科音分子动力学与GROMACS培训班简介：培训讲授内容的详细介绍参看http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html，页面会随着培训内容的不懈的改进和扩充而不断更新。此培训既非常详细讲授分子动力学的各种相关的理论知识、深入全面介绍GROMACS程序的使用，也详解VMD、Packmol以及许多讲授者自编的大量相关脚本和程序的使用（如Multiwfn、ba2r、genmixmem）。此培训既适合分子动力学初学者，使他们回去立刻能上手开展研究，也适合已有多年研究经验的分子动力学研究者查缺补漏、获得更多模拟技巧、掌握更多类型体系的模拟方法。本培训特别注重知识的系统性、全面性、完整性，考虑到不同类型体系、不同问题模拟的要点和流程差异较大，本培训把常见的模拟体系和常见的研究问题几乎全部囊括，一一进行了细致的讲解和演示、给出了大量例子，并且传授了诸多相关研究经验和技巧。学员在充分领悟所讲内容后稍加变通、举一反三，就能对于各种实际情况应对自如，不仅会跑模拟还知道怎么进行深入的分析。相反，目前社会上许多完全以盈利为目的的计算化学培训净是一些零散例子东拼西凑而成，结构凌乱，严重缺乏系统性、深度、信息量和含金量，参加者只能学到一些皮毛、对相关概念和程序使用只能做到一知半解。值得一提的是，北京科音分子动力学与GROMACS培训班不仅对于GROMACS使用者是极为宝贵的学习机会，AMBER、NAMD等其它分子动力学模拟程序的使用者的水平在此次课程中也能得到很大提高，因为相关模拟理论、各种问题模拟的背景知识、分析方法、可视化程序的使用在很大程度上都是共通的。

北京科音分子动力学与GROMACS培训班每年都会开办，从而不断让更多科研工作者能顺利踏入分子动力学研究的大门、提高分子动力学研究水平，推动我国计算化学事业的整体进步。下一届（第9届）本系列培训的举办时间预计于2021年3月或4月，欢迎大家关注和参加。另外，在2021年3月或4月还预计举办第14届北京科音初级量子化学培训班，培训介绍见http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html，这是新人系统性学习量子化学计算的又好、又快的渠道，能一次性学明白量子化学计算、不犯错误地顺利开展量子化学计算研究。这两个培训的报名时间将在培训开始前一个月在北京科音官网（http://www.keinsci.com）的首页预告，与培训有关的各种常见问题请参阅《北京科音办的培训班FAQ》，同时非常欢迎关注“北京科音”微信公众号以接受北京科音未来举办的培训的预告和提醒，避免不慎错过报名机会。

本次培训的现场照片：

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作者
Author: 三石草祭 时间: 2021-1-24 22:21
卢老师胖了

作者
Author: 独舞的印迹 时间: 2021-1-24 22:41
正在听着录音学习PPT。这是第三次参加卢老师的培训，每一次收获都很大，不管是量化还是MD，听了卢老师的课才知道自己之前都是在瞎算，虽然有意识到自己理论基础非常薄弱，但是高深的数学知识实在让我头大，只能硬着头皮继续搞。卢老师的课关于原理的部分讲的数学性不是太强，又会把大致的思路过一遍，让人知道自己是在干嘛，又不至于被数学难道。太爱卢老师这种教学思路了，不管是量化还是MD，总能把各种理论、方法的原理讲的清清楚楚，适用性以及效果也是信手拈来，而其他计算化学的培训在这些方面都是在打马虎眼，由此可见卢老师功力的深厚。

作者
Author: liuxdhs 时间: 2021-1-24 23:11
现场的70多人之一，面对疫情与学校及回程的各种政策压力，明知山有虎，偏向虎山行，可能就是咱们这几十个人吧。可能正是这份决心，让我格外珍惜此次培训，当然也正如期待收获满满。Sob老师的知识储备非常丰富，而且坐在台上几个小时不断的一直讲述培训知识，这超强的耐力让我非常敬佩，格外认真的准备意味着内容的丰满与完整。如此，希望能够春种一粒粟，秋收万颗子！

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2021-1-25 02:45
这场地好呀（估计也甚贵）

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-25 07:06

liyuanhe211 发表于 2021-1-25 02:45
这场地好呀（估计也甚贵）

场地费也是以前用的教室的N倍，巨贵
为了满足上级的疫情防控要求的人与人之间的距离，只得如此

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-25 07:20

独舞的印迹发表于 2021-1-24 22:41
正在听着录音学习PPT。这是第三次参加卢老师的培训，每一次收获都很大，不管是量化还是MD，听了卢老师的课 ...

有很多书，一堆数学公式，新人看得云里雾里，费半天劲也没弄清楚idea是什么、有什么价值，和计算联系不起来，然后很快就把书给弃了；还有些资料，纯粹是一些讲例子操作，然而新人如果不知道背后的基本原理，经常是胡算瞎算，浪费大量计算资源，犯一些明显低级错误都意识不到、遇到问题没有能力解决、完全无法根据实际情况变通，而且碰见内行审稿人对计算细节一问就懵了。只引入基本必要程度的数学公式，让参加者通过课程能快速弄明白自己在算什么、了解各种方法以及参数选择的思想和物理意义是什么，这是我的各种课程都注重追求的。那些有兴趣想把数学和物理细节、公式推导研究得很透彻的学员，在参加过这个培训有了知识的正确框架、整体全面认识后，再去看课程最后推荐的各种计算化学相关书籍，肯定会感觉顺利得多得多，知道重点在哪，有清晰的方向感，避免陷入数学迷宫里。

作者
Author: chengweiwei03 时间: 2021-1-29 15:06
太厉害了，以前只是在网上看卢老师的博文，这次很荣幸能参加培训，从原理到操作一步一步的教，内容的深度广度超乎想象；目前正在听着录音，回顾，学习，争取能融会贯通，早日进化成老鸟

；继续闭关修炼

作者
Author: cuijita 时间: 2021-2-5 21:13
太棒了，明年我要报名学习

作者
Author: mgqqlwq 时间: 2021-2-8 19:01
卢老师，请问我现在还想参加这次培训的话还可以吗？就像当时没去现场的学员那样，拿到资料后自己学习，还可以报名吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-8 20:54

mgqqlwq 发表于 2021-2-8 19:01
卢老师，请问我现在还想参加这次培训的话还可以吗？就像当时没去现场的学员那样，拿到资料后自己学习，还可 ...

可以

此文提到了
北京科音办的培训班FAQ
http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html

作者
Author: Qing 时间: 2021-2-9 23:04
sob老师，请问下一届gromcas培训官网说今年3-4月份还会有，大概什么时候会出具体报名通知呀

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-9 23:20

Qing 发表于 2021-2-9 23:04
sob老师，请问下一届gromcas培训官网说今年3-4月份还会有，大概什么时候会出具体报名通知呀

现在还不好说，因为各地疫情还没完全消停，而且三月还开两会干扰办培训。
我估计二月下旬差不多能定下来报名时间。至少会在培训开始前一个月时公布报名时间。请关注“北京科音”微信公众号，报名时间确定下来后会第一时间在公众号、科音官网以及本论坛首页进行预告。

作者
Author: Qing 时间: 2021-2-9 23:22

sobereva 发表于 2021-2-9 23:20
现在还不好说，因为各地疫情还没完全消停，而且三月还开两会干扰办培训。
我估计二月下旬差不多能定下来 ...

好的谢谢sob老师！

作者
Author: yygong 时间: 2021-2-10 18:28
卢老师讲义的最大特点清晰明了，不到场也能学会。我没有到现场去，这几天练习邮寄来讲义中的例子，99%都能成功运行，1%的是估计是自己那个地方没弄对，自己先继续折腾下，搞不定再来问

。

另外，希望卢老师以后的培训班向这次一样，提供不到场学习的名额。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-10 22:25

yygong 发表于 2021-2-10 18:28
卢老师讲义的最大特点清晰明了，不到场也能学会。我没有到现场去，这几天练习邮寄来讲义中的例子，99%都能 ...

我做讲义可谓费尽心血，平时还不断完善和扩充力争完美。

所有北京科音的培训都支持邮寄讲义+电子资料+录音+群里答疑方式学习。

动力学班有没运行成功的例子可以在分子模拟板块问。我提供的file文件包里都是通过讲义上的命令直接跑出来的文件，输入文件也都提供了，仔细对照一下应该都能容易发现哪里弄错了。

作者
Author: 光荣道彭于晏 时间: 2021-2-20 15:13
卢老师您好！我想报名学习模拟软件，报名之前想咨询一下。我是高分子跨到工程力学的，目前的课题算是材料学与力学的交叉学科，具体是：用具有双折射性质的透明聚合物材料模拟并研究岩石受力时的应力分布，也叫作应力可视化研究，而聚合物在玻璃化转变温度附近受载一定时间之后，移除温度和载荷，常温常压下透明聚合物在光源下可以透过双折射显示当时的应力分布状态，这叫作应力冻结效应。我的课题就是应力冻结机理的研究，通过文献调研，所谓的冻结，冻下来的其实是分子链段的取向，取向越高双折射现象越明显。课题的研究就变成了对取向的研究（其实我觉得这已经是凝聚态物理的范畴了），然而，非晶态聚合物的取向通过实验手段非常困难，除了通过红外光谱/红外二向色性这种方法之外，没有好的办法，于是比较可行的就是通过软件模拟进行研究。
我没有任何模拟的基础（数学水平也很差），目前只看过部分卢老师自己的博客，对于模拟软件可以实现什么运算、得到什么结果都没有概念。如果我想学的话，应该用哪种软件、报科音的哪个班呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-20 15:30

光荣道彭于晏发表于 2021-2-20 15:13
卢老师您好！我想报名学习模拟软件，报名之前想咨询一下。我是高分子跨到工程力学的，目前的课题算是材料学 ...

我对你的领域不了解，但从你的描述上看，应该是要涉及做聚合物的分子动力学模拟，尤其是可能需要跑退火的动力学模拟。这种问题适合用GROMACS跑，参加分子动力学与GROMACS培训班很适合，没有任何相关数学物理基础都没关系，会从头系统地、由浅入深讲。就算之后需要再通过其它程序辅助，有了这个班的背景知识，之后自学其它的也非常容易了。

作者
Author: 光荣道彭于晏 时间: 2021-2-20 15:46

sobereva 发表于 2021-2-20 15:30
我对你的领域不了解，但从你的描述上看，应该是要涉及做聚合物的分子动力学模拟，尤其是可能需要跑退火的 ...

第九届分子动力学与GROMACS培训班（预计2021年3月或4月，北京）

下一届培训班的时间还没确定吧，我再等一等。我最担心的是我这种完全零基础的，是否真的能学会相关知识和软件。

作者
Author: 光荣道彭于晏 时间: 2021-2-20 16:00

sobereva 发表于 2021-2-20 15:30
我对你的领域不了解，但从你的描述上看，应该是要涉及做聚合物的分子动力学模拟，尤其是可能需要跑退火的 ...

谢谢您，卢老师！我博士读到第三年了，一无所成慌得一批，希望在卢老师的指导下能学会相关知识和软件！我后续关注一下分子动力学开班的相关信息。
另外，这段时间我需要自学一些什么教材/教程吗？我曾经从图书馆借过十几本相关书籍，基本上就是看了也看不懂，过目就忘。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-20 16:46

光荣道彭于晏发表于 2021-2-20 15:46
下一届培训班的时间还没确定吧，我再等一等。我最担心的是我这种完全零基础的，是否真的能学会相关知识 ...

三月份办初级量化班，4月份办下一届动力学班（具体时间待定，三月会开始报名）

没必要自己事先看什么，上过这个培训后会发觉之前看一堆东西大多都白看。光看那些分子模拟、动力学理论方法方面的书，不结合实际问题做些计算，通常是看了过一阵就忘，始终不得要领。科音的动力学班对背景知识和实际计算兼顾，彻底扫除新人做计算的各方面障碍，绝对是最好的上手计算的学习渠道了。

作者
Author: 绫波レイ 时间: 2021-2-22 17:52

sobereva 发表于 2021-2-20 16:46
三月份办初级量化班，4月份办下一届动力学班（具体时间待定，三月会开始报名）

没必要自己事先看什么 ...

社长，4月19号到22号有中国化学会，记得错开时间

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-23 10:29

绫波レイ发表于 2021-2-22 17:52
社长，4月19号到22号有中国化学会，记得错开时间

科音的培训是不会刻意错开其它任何学术会议的时间的，唯一能令科音培训刻意错开的是在北京每年办的两会，这属于不可抗力

作者
Author: 绫波レイ 时间: 2021-2-25 11:53

sobereva 发表于 2021-2-23 10:29
科音的培训是不会刻意错开其它任何学术会议的时间的，唯一能令科音培训刻意错开的是在北京每年办的两会， ...

因为总感觉社长订的时间大概率是20-24号开课

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)