计算化学公社

标题: 求助：如何获得氧化锰模型的itp文件 [打印本页]

作者
Author: liurongjuan 时间: 2021-2-2 15:43
标题: 求助：如何获得氧化锰模型的itp文件
请教下各位老师: 我想用gromos54a7力场模拟接配体的氧化锰，氧化锰的模型用MS建立后该怎么获得其.itp文件呢？gromos54a7力场下没有Mn元素

作者
Author: tjuptz 时间: 2021-2-2 20:49
这个力场不适合氧化锰

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-3 05:01
G54A7是生物分子+有机分子力场，根本不直接支持过渡金属，问之前至少先看看力场相关介绍

作者
Author: liurongjuan 时间: 2021-2-20 09:58

sobereva 发表于 2021-2-3 05:01
G54A7是生物分子+有机分子力场，根本不直接支持过渡金属，问之前至少先看看力场相关介绍

老师好！我想建的是表面接配体的氧化锰模型，在体系中加入有机分子，探究氧化锰表面的配体分子和有机分子间的相互作用，应该选用什么力场合适呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-20 15:26

liurongjuan 发表于 2021-2-20 09:58
老师好！我想建的是表面接配体的氧化锰模型，在体系中加入有机分子，探究氧化锰表面的配体分子和有机分子 ...

如果你只是要算相互作用能，强烈建议你拿CP2K、Quantum ESPRESSO之类的第一性原理程序来算，算这种体系很容易。用力场精度不仅差得多，还得鼓捣参数和拓扑很麻烦

作者
Author: liurongjuan 时间: 2021-2-22 16:31

sobereva 发表于 2021-2-20 15:26
如果你只是要算相互作用能，强烈建议你拿CP2K、Quantum ESPRESSO之类的第一性原理程序来算，算这种体系很 ...

好的谢谢老师啦

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-23 10:28
顺带一提，最近刚写了这些帖子
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html）
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587（http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html）

用CP2K干这些事特别容易

作者
Author: liurongjuan 时间: 2021-2-25 09:13

sobereva 发表于 2021-2-23 10:28
顺带一提，最近刚写了这些帖子
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（h ...

好嘞谢谢老师

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