计算化学公社

标题: 求助：Gromacs模拟完四聚体变单体 [打印本页]

作者
Author: BabysBreath 时间: 2021-2-7 16:51
标题: 求助：Gromacs模拟完四聚体变单体
各位老师好，想麻烦问一下各位老师我再跑gromacs前用的结构是四聚体，但是再把四聚体拆成蛋白和小分子并且合起来后形成的gro文件，用editconf转换成pdb文件的时候，pymol显示是单体，并且即便是模拟完后用editconf转换的pdb也是单体，所以想麻烦问一下各位老师，这个是editconf会直接转换成单体还是说我整个模拟过程中被当作单体处理呀？谢谢各位老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-7 21:52
到底结构文件里有什么，直接打开pdb文件一看便知

建议用VMD查看

作者
Author: BabysBreath 时间: 2021-2-9 08:10

sobereva 发表于 2021-2-7 21:52
到底结构文件里有什么，直接打开pdb文件一看便知

建议用VMD查看

好哒，谢谢社长~

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)