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标题: TS计算正常收敛,虚频正常;但是IRC曲线错误的原因 [打印本页]

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chenxin199261    时间: 2014-11-7 20:11
标题: TS计算正常收敛,虚频正常;但是IRC曲线错误的原因
我用TS对一个过渡态进行优化,结果收敛,检查虚频,虚频方向正确。
我用这个过渡态结果计算IRC。但结果显然是错误的。通过看动画发现,原子向反应物方向走几步,又反返回了。
IRC输入文件输入如下

################################################
%nprocshared=24
%chk=FeONH36-TS-5-IRC-p.chk
# irc=(maxpoints=10,calcall) ub3lyp/genecp geom=connectivity scf=xqc

5  2
....


Fe 0
lanl2dz
****
C H O N 0
6-31g(d,p)
****

Fe 0
lanl2dz
###############################################


由于多重度是5,计算SCF收敛有点困难,故加上XQC


麻烦各位了,如果遇到同样问题,麻烦指导一下。


作者
Author:
sobereva    时间: 2014-11-7 20:54
你的多重度设的是2,电荷是+5,和你描述不符。

先确认过渡态结构定位得很准确,用int=ultrafine结合tight优化收敛限,并且最好calcall,然后再做IRC试试。

如果问题依旧,把IRC的步长调小点,或者尝试别的IRC生成算法。
作者
Author:
chenxin199261    时间: 2014-11-7 20:59
sobereva 发表于 2014-11-7 20:54
你的多重度设的是2,电荷是+5,和你描述不符。

先确认过渡态结构定位得很准确,用int=ultrafine结合tigh ...

好的,我在论坛上打错了,gaussian计算时多重度跟电荷没反。

我TS优化calcall已经用上了。
接下来。我打算按您说的int=ultrafine 并结合tight重新计算。
谢谢您
作者
Author:
chenxin199261    时间: 2014-11-11 12:22
sobereva 发表于 2014-11-7 20:54
你的多重度设的是2,电荷是+5,和你描述不符。

先确认过渡态结构定位得很准确,用int=ultrafine结合tigh ...

按您说的,我的问题解决了,谢谢你
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-14 19:43
chenxin199261 发表于 2014-11-11 12:22
按您说的,我的问题解决了,谢谢你

您好,我现在遇到了和您一样的问题,就是用TS找过渡态,正常收敛,有一个虚频,虚频模式正确,但是跑irc的时候只能往产物方向跑,往反应物跑几步就会折返或者终止。所以想请问您最后是怎么解决的呢?重新找到的过渡态和之前的结构差别大吗?

作者
Author:
sobereva    时间: 2019-1-15 02:36
wyy015020 发表于 2019-1-14 19:43
您好,我现在遇到了和您一样的问题,就是用TS找过渡态,正常收敛,有一个虚频,虚频模式正确,但是跑irc ...

仔细看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-17 20:13
sobereva 发表于 2019-1-15 02:36
仔细看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400(http://bbs.keinsci.com/threa ...

谢谢sob老师
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-17 20:37
sobereva 发表于 2019-1-15 02:36
仔细看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400(http://bbs.keinsci.com/threa ...

sob老师,我现在加了tight和int=ultrafine优化过渡态,然后进行irc分析两边曲线走出来还是一样的,调大步长也不行。现在用calcall对过渡态重新优化,发现过渡态的结构和之前的结构没有区别,键长键角以及能量都差不多,请问我还有别的尝试方法吗?还是这个过渡态结构压根就是不对的?

作者
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sobereva    时间: 2019-1-18 00:18
wyy015020 发表于 2019-1-17 20:37
sob老师,我现在加了tight和int=ultrafine优化过渡态,然后进行irc分析两边曲线走出来还是一样的,调大步 ...

看虚频模式,足够80%确定过渡态是不是你想要的
即便过渡态不是你想要的,只要过渡态是准确的势能面的一阶鞍点,原理上IRC总能正常跑下去
走IRC相关问题该说的我在博文里都说了,没有可以补充的
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-20 11:27
sobereva 发表于 2019-1-18 00:18
看虚频模式,足够80%确定过渡态是不是你想要的
即便过渡态不是你想要的,只要过渡态是准确的势能面的一 ...

好的,谢谢您,我再试试
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-20 11:50
本帖最后由 wyy015020 于 2019-1-21 20:35 编辑

sob老师,不好意思再打扰您一下,我刚刚看了优化过渡态的能量是E=-1221.36780221,然后将这个过渡态结构跑IRC,对应坐标为0的能量却是-1221.37933361,请问这是什么原因呢?我是将优化出的TS结构直接写在IRC输入文件里的,其他的过渡态我都是这样操作的,都能正常的跑IRC,就这个出现了这种问题

作者
Author:
sobereva    时间: 2019-1-20 15:19
wyy015020 发表于 2019-1-20 11:50
sob老师,不好意思再打扰您一下,我刚刚看了优化过渡态的能量是E=-1227.36780221,然后将这个过渡态结构跑IR ...

8成是做优化和跑IRC用的影响能量的关键词不同
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-21 09:24
老师,我把关键词发给您看一下,优化过渡态:# M062X/6-311G(d,p) opt(calcfc,ts,noeigen,maxstep=3,notrust) freq scrf=smd int=ultrafine
跑IRC: # M062X/6-311G(d,p) irc(calcfc,maxpoint=20,stepsize=15,LQA) int=ultrafine scrf=smd
还请您指导一下
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-1-21 16:33
wyy015020 发表于 2019-1-21 09:24
老师,我把关键词发给您看一下,优化过渡态:# M062X/6-311G(d,p) opt(calcfc,ts,noeigen,maxstep=3,notrus ...

光从这上看不出什么来。走IRC时候加上guess=read读取优化任务的chk再试
作者
Author:
wyy015020    时间: 2019-1-22 17:18
感谢sob老师,按您说的方法,我的问题解决了,谢谢您
作者
Author:
哈哈哈    时间: 2019-4-28 15:17
wyy015020 发表于 2019-1-17 20:37
sob老师,我现在加了tight和int=ultrafine优化过渡态,然后进行irc分析两边曲线走出来还是一样的,调大步 ...

请问就你说的这种情况你最后怎么解决的安?




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