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标题: ORCA做AIMD时莫名停滞 [打印本页]

作者
Author: shalene 时间: 2021-2-27 09:35
标题: ORCA做AIMD时莫名停滞
3950X，模拟设定10000步，至今才2000多已经停滞2次了，现象是没有任何错误报告下，进程的cpu占用从100%降到1%并保持这个状态。

值得一提的，模拟相同分子不同温度的另一台2683v3没有这种错误，始终平稳运行。

两台OS都一样的。

哪位知道怎么解决？谢谢

作者
Author: biogon 时间: 2021-2-27 10:51
这恐怕得去orca论坛问neese了，也许是什么bug

作者
Author: sobereva 时间: 2021-2-27 14:27
动力学过程中会产生一些.log，比如其中有记录SCF迭代过程等更细节信息的文件，看看里面的内容。看不出问题就只能去官方论坛问开发者了。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-2-27 14:29
用的是什么版本的orca？旧版的orca跑AIMD会越跑越慢，后来4.1.0还是4.2.0修复了

作者
Author: wuzhiyi 时间: 2021-2-27 18:38
看看是不是用的openmpi3
换成2会改善
https://orcaforum.kofo.mpg.de/vi ... &p=24996#p24996

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-2 02:08

wzkchem5 发表于 2021-2-27 14:29
用的是什么版本的orca？旧版的orca跑AIMD会越跑越慢，后来4.1.0还是4.2.0修复了

越跑越慢的问题我发现在4.2.1依然有，所以每次我都每次跑<=两千步，长轨迹分多段跑

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-3-2 03:46

sobereva 发表于 2021-3-2 02:08
越跑越慢的问题我发现在4.2.1依然有，所以每次我都每次跑

是吗？我好像4.2.1没有遇到这种问题

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-3 01:24

wzkchem5 发表于 2021-3-2 03:46
是吗？我好像4.2.1没有遇到这种问题

双路Intel E5-2696v3，256GB内存，CentOS 7， ORCA 4.2.1，OpenMPI 3.1.4。跑多个体系都有类似问题

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