计算化学公社

标题: GROMACS GPU加速求助 [打印本页]

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Author: hdhxx123 时间: 2021-3-2 19:47
标题: GROMACS GPU加速求助
老师们好，想跑Gromacs的CUDA GPU加速，机子的显卡是Quadro M5000M，原来用的Hyper-V是看网上说没法用N卡CUDA加速，所以想咨询一下：1.该显卡条件下，对比Sob老师编译的WIN版2020.3 CUDA GPU 加速版GROMACS，考虑虚拟机对显卡驱动的影响，是否有必要在Linux下跑GROMACS？
2.如果有必要，当前Win10专业版的系统想要在Linux（最好是Centos8）里跑CUDA加速的话用什么虚拟机比较好？

提前感谢大佬们的帮助！
附上显卡GPU-Z图片和系统版本。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-2 20:12
不要把图片用bmp压缩成文件包上传，别人还得再下载。用jpg或者png格式直接贴就完了

目前的常用的虚拟机不支持客户机里GPU加速，考虑虚拟机里GPU加速跑gmx也根本没意义。要么直接用我预编译的GPU加速的GROMACS windows版，要么用实体linux，由于计算量主要在GPU上，速度不会相差太多。

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-2 20:26

sobereva 发表于 2021-3-2 20:12
不要把图片用bmp压缩成文件包上传，别人还得再下载。用jpg或者png格式直接贴就完了

目前的常用的虚拟机 ...

明白了，谢谢社长！

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-2 20:29
另：还想咨询一下 Quadro M5000M跑GPU加速的效率如何？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-3 01:27

hdhxx123 发表于 2021-3-2 20:29
另：还想咨询一下 Quadro M5000M跑GPU加速的效率如何？

过时的玩意儿，能凑合用，但比现在高端GPU差远了

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-3 10:08

sobereva 发表于 2021-3-3 01:27
过时的玩意儿，能凑合用，但比现在高端GPU差远了

了解，谢谢社长

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-3 10:45
本帖最后由 hdhxx123 于 2021-3-3 10:53 编辑

sobereva 发表于 2021-3-3 01:27
过时的玩意儿，能凑合用，但比现在高端GPU差远了

老师，那RTX 2060 6G相比这个在GPU加速方面要优秀得多是吗？是直接比较CUDA核心数就可以了么？

作者
Author: cheviax 时间: 2021-3-3 16:55
2060相比M5000确实强很多
同代同系列的卡确实是cuda核心数多的更好，但提升不线性，5888核心的3070才比1920核心的2060效率高一半左右

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-3 21:26
本帖最后由 hdhxx123 于 2021-3-3 21:27 编辑

cheviax 发表于 2021-3-3 16:55
2060相比M5000确实强很多
同代同系列的卡确实是cuda核心数多的更好，但提升不线性，5888核心的3070才比192 ...

明白了，如果有GPU效率横测就好了（现在要做得找矿老板了）
我看到M5000M是128,2060 6G能到一千多，提升了十倍都惊了

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-4 00:38

hdhxx123 发表于 2021-3-3 21:26
明白了，如果有GPU效率横测就好了（现在要做得找矿老板了）
我看到M5000M是128,2060 6G能到一千多，提升了 ...

对于MD计算，quadro系列根本别考虑，性价比极低。本来Quadro定位就是专业作图方面的

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Author: hdhxx123 时间: 2021-3-4 09:07

sobereva 发表于 2021-3-4 00:38
对于MD计算，quadro系列根本别考虑，性价比极低。本来Quadro定位就是专业作图方面的

好的，谢谢sob老师

作者
Author: cheviax 时间: 2021-3-4 09:34

hdhxx123 发表于 2021-3-3 21:26
明白了，如果有GPU效率横测就好了（现在要做得找矿老板了）
我看到M5000M是128,2060 6G能到一千多，提升了 ...

http://bbs.keinsci.com/thread-20114-1-1.html
这有，不是很全，2060性价比相当高了，算力远超10系，30系也暂时没甩开20系

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-4 10:28

cheviax 发表于 2021-3-4 09:34
http://bbs.keinsci.com/thread-20114-1-1.html
这有，不是很全，2060性价比相当高了，算力远超10系，30 ...

感谢

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