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标题: Gaussian版本的问题？ [打印本页]

作者
Author: savorw 时间: 2015-11-19 09:41
标题: Gaussian版本的问题？
现在看到的Gaussian 09 D01有两种版本, 一种是以前常见的EM64L, 应该是对应EM64T的CPU的，另一种是ES64L，不知这个ES是什么意思？是不是更好更新，
测了一下速度， ES64L的快约7-8%小胜。请熟悉的大大们指教一下。同时也测试一个A01和D01的差别，发现两者在优化相对较大分子上opt真是完全不一样，收敛的点数相差好大。以前高斯版本较稳定，同一输入，基本优化得一样，现在看来得小心了，计算结果最好都用同一种版本，不知大家有没有思考过这个问题？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-11-19 09:56
版本号不清楚，但是同一个任务同一版本同一机器的运行时间我测出过差10%的。不知道为什么。单观察l502进程的时间还比较稳定。

作者
Author: savorw 时间: 2015-11-19 10:06

liyuanhe211 发表于 2015-11-19 09:56
版本号不清楚，但是同一个任务同一版本同一机器的运行时间我测出过差10%的。不知道为什么。单观察l502进程 ...

还有这样的情况? 第一次听说, 也许你机器系统不稳定?按说一个任务同一版本同一机器不会有10%的差.

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-11-19 10:29

savorw 发表于 2015-11-19 10:06
还有这样的情况? 第一次听说, 也许你机器系统不稳定?按说一个任务同一版本同一机器不会有10%的差.

不常发生，但是有。没有观察到其他问题。对CPU的监测记录（频率，占用率，温度）等也一直是正常得的

作者
Author: milkxx 时间: 2015-11-19 11:16
不清楚ES含义，不过 B版本开始默认使用GEDIIS做优化，结果有些差异也是可以理解的

作者
Author: sobereva 时间: 2015-11-19 11:58
所有计算都应当用D.01，绝对比很早期bug一堆的A.01可靠，如果碰巧后者更合理那也绝对是巧合。

EM64L和ES64L的差异没专门研究过，但g09有传统版本（兼容性最佳）和为SSE4.2优化的版本，后者更快，有可能是对这个区分。

作者
Author: savorw 时间: 2015-11-19 12:03

sobereva 发表于 2015-11-19 11:58
所有计算都应当用D.01，绝对比很早期bug一堆的A.01可靠，如果碰巧后者更合理那也绝对是巧合。

EM64L和ES ...

以前到手D01后优化反而老中断出错, A01却无此问题, 故现在一直用A01. 昨天测试的同一作业, A01优化结构收敛慢不少, 但优化出来的能量却比D01低0.7 kcal/mol, 由于做不同手性TS的Gibbs能差本就小, 所以现也很迷糊哪一个更好.

作者
Author: sobereva 时间: 2015-11-19 12:56

savorw 发表于 2015-11-19 12:03
以前到手D01后优化反而老中断出错, A01却无此问题, 故现在一直用A01. 昨天测试的同一作业, A01优化结构收 ...

A.01就彻底别用它，bug太多，其中有一些严重的。
如果D.01老是中断之类的，应尝试用B.01、C.01。
结果得很谨慎对比，不能只看能量结果。

作者
Author: savorw 时间: 2015-11-19 17:45

sobereva 发表于 2015-11-19 12:56
A.01就彻底别用它，bug太多，其中有一些严重的。
如果D.01老是中断之类的，应尝试用B.01、C.01。
结果 ...

已换ES64LD01版本试试，A01的确太老了。现做的体系又大，D01应该好些和快些。

作者
Author: anmin0127 时间: 2015-11-20 09:04
这种商业化软件必须用新的啊，出新的就是为了修复原来存在的问题的

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