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标题: 求助:水分子周围范德华势分析 [打印本页]

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lining    时间: 2021-3-3 16:38
标题: 求助:水分子周围范德华势分析
本帖最后由 lining 于 2021-3-3 16:53 编辑

老师您好,我参照谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制(http://sobereva.com/551)得到了水分子周围的范德华势分布情况(Isovalue=-0.14),对为何是这种分布有些许疑问:
1. 氢和氧原子顶部无明显范德华势是由于原子的色散吸引不够集中,叠加效果不够明显导致的么?
2. 图中水分子周围下半部分的范德华势比较明显,这是由于氢原子的半径较小,在距离氢原子较近的区域,色散吸引有较大的叠加效果,而氧原子半径较大,在氧原子较远的地方出现色散吸引,而此处氢原子由于色散吸引衰减的很剧烈,因而叠加后总的色散吸引不是很明显,这样分析正确么?3. 吸引子非常多,这些都是极小点么?是不是有数值噪音啊?
麻烦sob老师有时间帮忙解答一下吧,非常感谢~



作者
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sobereva    时间: 2021-3-3 19:15
1 你把等值面数值设小,照样可以在氧的上面看到负值部分等值面。等值面图并不能全面表现各个位置的范德华势的大小,像这种简单体系绘制一个平面图能把范德华势展现得全面充分得多

2 正确

3 是。数值差不多,基本是简并的
作者
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lining    时间: 2021-3-3 19:41
sobereva 发表于 2021-3-3 19:15
1 你把等值面数值设小,照样可以在氧的上面看到负值部分等值面。等值面图并不能全面表现各个位置的范德华势 ...

好的,明白了卢老师,非常感谢您的解答~




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