计算化学公社

标题: 薄膜沉积用gromacs和lammps有什么区别吗？ [打印本页]

作者
Author: 陈曦 时间: 2021-3-4 11:22
标题: 薄膜沉积用gromacs和lammps有什么区别吗？
请问用gromacs实现薄膜沉积和lammps实现，两个有什么区别吗？看了相关文献，很多都是lammps实现，也有用gromacs实现的。
觉得gromacs好上手一些？而且计算比较快，但是gromacs关于沉积的资料比较少。lammps做的比较多，但是计算速度慢，我找到的资料也很少。
我是小白，对lammps有些了解，这几天才知道gromacs的一些性能。请问大家能给我些建议吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-4 16:27
说清楚体系具体特征，是什么类型物质。但凡适合GROMACS描述的情况一律用GROMACS

作者
Author: mol 时间: 2021-3-4 17:23
可能研究金属表面沉积金属的用lammps的多，如果金属表面沉积有机分子的话也有用gromacs的，需要自己写脚本每间隔一定时间往体系里添加一个分子。

作者
Author: 陈曦 时间: 2021-3-6 17:10

sobereva 发表于 2021-3-4 16:27
说清楚体系具体特征，是什么类型物质。但凡适合GROMACS描述的情况一律用GROMACS

630不锈钢上溅射沉积二氧化硅或者氧化铝，以及在二氧化硅上溅射沉积合金（镍铬合金和卡玛合金等），想要研究不同的材料以及不同的工艺参数。
请问这两种类型可以在GROMACS上实现吗？

作者
Author: 陈曦 时间: 2021-3-6 17:12

mol 发表于 2021-3-4 17:23
可能研究金属表面沉积金属的用lammps的多，如果金属表面沉积有机分子的话也有用gromacs的，需要自己写脚本 ...

请问沉积后薄膜的一些性质，粗糙度、内应力、密度也可以自己写脚本计算吗？还是导出到其他软件计算呢？
请问要是没有人带，自学的话这个实现起来难吗？

作者
Author: tjuptz 时间: 2021-3-6 18:28

陈曦发表于 2021-3-6 17:10
630不锈钢上溅射沉积二氧化硅或者氧化铝，以及在二氧化硅上溅射沉积合金（镍铬合金和卡玛合金等），想要 ...

这个材料你看到有用gromacs的吗？应该还是用lammps合适的

作者
Author: 陈曦 时间: 2021-3-6 20:14

tjuptz 发表于 2021-3-6 18:28
这个材料你看到有用gromacs的吗？应该还是用lammps合适的

好的，谢谢！有看到二氧化硅沉积到二氧化硅上的，其他的没有看到过。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-7 05:36

陈曦发表于 2021-3-6 17:10
630不锈钢上溅射沉积二氧化硅或者氧化铝，以及在二氧化硅上溅射沉积合金（镍铬合金和卡玛合金等），想要 ...

此类情况不适合GROMACS

作者
Author: 陈曦 时间: 2021-3-8 09:59

sobereva 发表于 2021-3-7 05:36
此类情况不适合GROMACS

好的，谢谢老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)