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标题: 求助过渡金属配合物的催化反应计算的赝势基组选择 [打印本页]

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Author: mt13 时间: 2021-3-6 19:36
标题: 求助过渡金属配合物的催化反应计算的赝势基组选择
学习了sob老师“谈谈赝势基组的选用”http://sobereva.com/373一文，现在我是计算过渡金属配合物的催化反应，有几个问题想请教各位老师：
1、lanl系列赝势基组的带弥散的版本是指的BSE库里的lanl08+和lanl2TZ+吗，但是这两个加弥散的版本只有第四周期过渡金属的，如果后面过渡周期需要加弥散，就没法用lanl系列了吧；
2、我现在计算了一些铬的配合物的催化反应的势垒，我是在PBE0/6-31g**进行opt、freq计算，在PBE0/6-311+g**算更高精度单点，其中铬在opt、freq和高精度单点都是用的SDD，没有加弥散。sob老师另一篇文章说“对于计算反应势垒，加弥散有益”，可能也不是必须加弥散的，那我对铬这样处理是否可以？
3、对于同时计算第四、五、六周期，如果都想用加弥散的赝势基组，cc-pVnZ-PP用在普通dft不划算，def2第四周期仍是全电子基组，lanl系列按照我在问题1中的猜测，只有第四周期过渡金属加弥散的版本，别的元素没有，所以也没法用，那是否就只能用even-tempered方式给SDD加弥散了？
4、对于过渡金属配合物里还有I、Br元素，对过渡金属用SDD，对主族元素用lanl08(d)是否显得奇怪？对于主族元素，SDD里的小核MDF的精度和lanl08(d)相比如何？我为了波函数分析，所以主族要用小核赝势，对过渡金属用SDD，对主族用小核MDF或者lanl08(d)，这两种搭配是否都合适？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-6 20:10
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，避免有任何歧义，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“过渡金属配合物计算的赝势基组选择”改了，以后务必注意。

当前问题和Gaussian没必然关系，不要选择Gaussian/gview分类，给你改了

作者
Author: mt13 时间: 2021-3-6 20:13

sobereva 发表于 2021-3-6 20:10
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，避免 ...

好的老师，我会注意的

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-6 20:28
1 是
2 单点如果能用def2-TZVP算得动就用这个。此时加不加弥散对势垒影响甚微。没必要再考虑混合基组

作者
Author: mt13 时间: 2021-3-8 07:57

sobereva 发表于 2021-3-6 20:28
1 是
2 单点如果能用def2-TZVP算得动就用这个。此时加不加弥散对势垒影响甚微。没必要再考虑混合基组

谢谢老师

作者
Author: xxzj 时间: 2021-5-27 21:24

sobereva 发表于 2021-3-6 20:28
1 是
2 单点如果能用def2-TZVP算得动就用这个。此时加不加弥散对势垒影响甚微。没必要再考虑混合基组

老师，我使用正常的b3lyp/6-31g*方法计算镍卟啉时，分子呈现扭曲结构，但是给镍加赝势基组后，分子结构却变成平面了，两种方法都全部满足收敛标准，而且没有虚频，所以，想请问老师，我现在应该选择哪种方法计算获得的基态几何构型？

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Author: hdhxx123 时间: 2021-5-27 22:28

xxzj 发表于 2021-5-27 21:24
老师，我使用正常的b3lyp/6-31g*方法计算镍卟啉时，分子呈现扭曲结构，但是给镍加赝势基组后，分子结构却 ...

卟啉体系如果是大共轭的话用b3lyp并不合适，建议用wB97XD

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-27 22:43

xxzj 发表于 2021-5-27 21:24
老师，我使用正常的b3lyp/6-31g*方法计算镍卟啉时，分子呈现扭曲结构，但是给镍加赝势基组后，分子结构却 ...

不宜用B3LYP
B3LYP既不适合大共轭，而且对于过渡金属配合物也不是好的选择，仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557（http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html）

你这种体系可以用MN15

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-27 22:56

xxzj 发表于 2021-5-27 14:24
老师，我使用正常的b3lyp/6-31g*方法计算镍卟啉时，分子呈现扭曲结构，但是给镍加赝势基组后，分子结构却 ...

补充一句，建议检查一下波函数，这种体系（过渡金属+大共轭配体）容易有不止一个稳定波函数。搞不好并不是赝势的问题，而是两个计算恰好收敛到了两个不同的波函数。

作者
Author: xxzj 时间: 2021-5-28 08:04

wzkchem5 发表于 2021-5-27 22:56
补充一句，建议检查一下波函数，这种体系（过渡金属+大共轭配体）容易有不止一个稳定波函数。搞不好并不 ...

好滴，谢谢老师

作者
Author: xxzj 时间: 2021-5-28 08:05

sobereva 发表于 2021-5-27 22:43
不宜用B3LYP
B3LYP既不适合大共轭，而且对于过渡金属配合物也不是好的选择，仔细看
谈谈量子化学研究中 ...

好滴，谢谢老师

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