计算化学公社

标题: 在vmd中有什么方法可以在考虑PBC的情况下得到两个原子间的距离？ [打印本页]

作者
Author: 向往阳光 时间: 2021-3-7 15:27
标题: 在vmd中有什么方法可以在考虑PBC的情况下得到两个原子间的距离？
在vmd中用measure bond计算两个原子的距离好像不能处理PBC，以至于在PBC上看来很近的两个原子算出来的距离很远。那在vmd中有什么方法可以在考虑PBC的情况下得到两个原子间的距离？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-7 23:54
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并反映出帖子具体内容，避免有任何歧义，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“measure bond处理PBC”改了，以后务必注意

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-8 00:07
https://www.ks.uiuc.edu/Research ... st/vmd-l/27057.html

作者
Author: 向往阳光 时间: 2021-3-8 19:07

sobereva 发表于 2021-3-8 00:07
https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/mailing_list/vmd-l/27057.html

谢谢老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)