计算化学公社

标题: 购机求配置建议 [打印本页]

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Author: azero 时间: 2021-3-7 17:21
标题: 购机求配置建议
本帖最后由 azero 于 2021-3-8 09:42 编辑

打算配1W7左右的机子
下面是暂定配置

CPU： XEON E5-2678 v3（可能换更好的） 2个

散热器：酷冷至尊T400i*2 2个

主板：超微 X10DAI （X10DAL-i没货）

硬盘：希捷ST4000NM0033企业级4TB SATA

内存：三星DDR4-2400 ECC 8GB 4条（QM/MM不一定会做，纠结要不要换8GB*8 还是 16G*4，还是说先四条8G到时再升级。没做过多少量化内存通道没概念）

显卡：2060 6G显存耕升/映众/索泰/技嘉/微星，6G显存版本 2张，打算GMX常开两任务

电源：振华LEADEX HG 650W （未定，可能功率不够）

机箱：先马黑洞玻璃版

键盘鼠标：罗技MK200 多媒体套装

显示器：优派VA2211-A 21.5寸

主要是GMX，偶尔amber，可能后面会用CP2K做一点QM/MM

没做过什么量化，CPU和内存没概念。希望各位多给建议

作者
Author: monoyu 时间: 2021-3-7 23:07
且不说能不能买到，现在2张2060得炒到7,8千了吧。4通道配2条16GB内存没看懂是啥操作。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-7 23:58
经常同时跑两个gmx任务配俩2060没问题

倘若以后要跑点量化/第一性原理的计算，必须增加内存条数以充分利用内存通道。预算该加的加。

作者
Author: azero 时间: 2021-3-8 09:44

monoyu 发表于 2021-3-7 23:07
且不说能不能买到，现在2张2060得炒到7,8千了吧。4通道配2条16GB内存没看懂是啥操作。

对的2张2060就已经很贵，要是去年配得便宜三四千。内存和CPU没什么概念=0=

作者
Author: azero 时间: 2021-3-8 09:44

sobereva 发表于 2021-3-7 23:58
经常同时跑两个gmx任务配俩2060没问题

倘若以后要跑点量化/第一性原理的计算，必须增加内存条数以充分利 ...

QM/MM后面不一定会做，而且没有经验，
对CPU和内存没概念，这两个硬件不会选

纠结内存要不要换8GB*8 还是 16G*4，还是说先四条8G到时再升级

作者
Author: Picardo 时间: 2021-3-8 11:57
显卡确实太贵了现在，之前寻思自己组个服务器给本科生玩玩，在闲鱼上淘到了X10DRL和2683v3双路，整个配下来5000多，不过对这个不熟的话还是老老实实买整机吧

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Author: 落伦丹的秋天 时间: 2021-3-17 21:10
可以买AMD的cpu 3950 3900

作者
Author: KevinLee 时间: 2021-3-24 17:23
测试

作者
Author: KevinLee 时间: 2021-3-24 17:23
买靠谱的翻新显卡吧

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Author: KingHPC 时间: 2021-3-26 09:58
做计算用的工作站，最好是全配服务器级别的，你这个配置一半是PC级别，一半是server级别，无法评价。电源还是建议用长城1250W金牌全模，通过15年从业经验说，稳定电源很重要，机箱建议使用追风者。内存建议32G*4（计算类，内存还是要足够大比较好，但是也要考虑软件方面的因素）。硬盘建议8T，系统盘建议采用三星500G nvme，启动足够快

作者
Author: abin 时间: 2021-3-26 10:22
本帖最后由 abin 于 2021-3-26 16:45 编辑

KingHPC 发表于 2021-3-26 09:58
做计算用的工作站，最好是全配服务器级别的，你这个配置一半是PC级别，一半是server级别，无法评价。电源还 ...

“系统盘用NVME盘, 启动足够快, 这就是外行了. ”
干活用的工作站, 还需要频繁开机启动?

合理的做法,
在预算允许的前提下,
100元一个固态全盘用来做系统, 60GB也够用, 不过买不到.
如需要高速读写,
NVME直接挂到/tmp, 很多程序默认在/tmp读写.

机械盘, 容量根据需求选, 挂到/home做数据, 软件也可以放在这个机械盘中.

做计算过程中, 可执行的二进制文件,
是从内存读取到内存中再执行的.
比如常见的高斯, DFT计算中等尺度体系,
并不会看到程序频繁变更为不同的link, 通常是一个link需要跑很久.
也就是说一个Link占用的CPU时间, 远远高于Link加载到内存的时间.
那么, 是否用高速硬盘来加速软件加载过程, 就没有什么意义了.

对于ORCA, 多数模块都需频繁读写,
那么, 直接把读写指定到/tmp, 效果会最佳.

分盘的好处. 成本低廉, 一个100GB出头的固态盘, 大约100元.
如果100元可以买到机械, 也可以用机械啊.

实际用途是:
1 系统和数据软件分离, 相对安全可靠.
2 就算系统高挂了, 重装也不会磨掉原来的配置. 仅需拔掉其他硬盘线缆, 然后默认全盘安装. 然后再接上其他盘, 挂载一下硬盘就OK了.

对于计算工作站服务器而言,
高速硬盘是用来应对并行计算读写的, 不是用来加速系统启动的.

按照普通的观点, 频繁读写, 固态容易挂,
当然是分开比较好了.

京东上多数产品都说3年或者5年质保,
单独挂载, 使劲读写, 坏了就换, 啥都不耽误.

拿NVME盘装系统, 真是外行到家了.

干活用的工作站服务器, 都是常年不关机, 不重启的.
要启动足够快, 有啥意义?

“计算要内存大, 建议32GB x 4,”
这是有多外行呀?
双路E5处理器, 不搞8个内存条, 还用4个, 你不嫌并行计算跑的慢吗?

以上言论, 仅仅代表我个人观点.
补充一下, 以免被质疑满嘴跑火车.

(, 下载次数 Times of downloads: 48)
图片,
最上面, 是一个小规模集群, 6个节点, 这是登录兼干活节点的uptime.
中间, 是另一套集群, 目前16节点规模, 图片信息是登录节点uptime.
最下面, 是自己“工作站”, 台式机. 如非必要, 大概一个月会启动一次.

对于好几周, 甚至是大半年才会重新开机启动一次的机器,
是否采用固态硬盘加速开机启动速度, 没有任何实际意义. 毕竟, 服务器主板自检过程就比较慢的.

现在一般的逻辑, 都是认为, 固态盘, 写多了, 就挂了.
如果这个逻辑成立, 而且计划采用NVME等高规格固态加速读写,
更应该系统单独一个盘, 读写单独一个盘. 换读写盘, 很容易.
装系统, 恢复软件配置, 多数情形下, 不是一件轻松的事情.

作者
Author: KingHPC 时间: 2021-3-26 10:35
本帖最后由 KingHPC 于 2021-3-26 10:40 编辑

abin 发表于 2021-3-26 10:22
“系统盘用NVME盘, 启动足够快, 这就是外行了. ”
干活用的工作站, 还需要频繁开机启动?

用nvme做系统的，系统和数据分离，内存建议使用4条是32G，总量比他以前的还多，目前的市场上，16G内存还能找么？在资金充足情况下，通常是有多少槽就满配。抛开资金谈配置，都是耍流氓。

作者
Author: abin 时间: 2021-3-26 16:49
本帖最后由 abin 于 2021-4-1 11:07 编辑

KingHPC 发表于 2021-3-26 10:35
用nvme做系统的，系统和数据分离，内存建议使用4条是32G，总量比他以前的还多，目前的市场上，16G内存还 ...

看你签名, 应该是做硬件的.
16GB DDR4服务器内存, 有没有货, 你渠道应该很多的.
你可以别告诉我, 京东上买到的都是不能用的.

我刚刚好奇看了眼, 京东上有货啊.

不才这几天, 就把原来8*8GB搞成8*16GB.

不晓得图片为何加载不了？
我刚刚买了16条16GB内存条升级了自己的服务器。
怎么就买不到呢？

作者
Author: ghost 时间: 2021-3-30 11:37
中肯一点的意见：1.如果cpu可以提高一点预算，建议用E5-2680v4 14核28线程 2.4主频这款cpu的性价比还是比较高的。2.内存部分2680v4单颗支持四通道，建议是8条内存，充分发挥内存通道。3.x10dai这款主板是16条内存，对于2680v4来说有点浪费，可以选择8个内存插槽的主板就可以，能有效发挥性能为主。4.这款主板并不支持nvme m.2固态盘，如果要用还需要配一个转接卡，如果以稳定为前提，建议配一块sata的固态盘做系统或者就直接用机械盘尚可。5，显卡现阶段的价格属于坑爹的阶段，如果不是刚需，建议还是不要现在购买。6.其他配件以稳定为主，至于用什么品牌无所谓，每个品牌也都有高端和低端产品。

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