计算化学公社

标题: 求助:用gromacs模拟金与水的界面如何使金处于负电势? [打印本页]

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邱美佳    时间: 2021-3-8 11:43
标题: 求助:用gromacs模拟金与水的界面如何使金处于负电势?
我想用gromacs模拟金与水的界面,请问如何使金处于负电势而不是中性的呢?

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cheviax    时间: 2021-3-8 15:19
设置电势需要改源代码,加原子电荷就行了
作者
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邱美佳    时间: 2021-3-8 20:13
cheviax 发表于 2021-3-8 15:19
设置电势需要改源代码,加原子电荷就行了

请问原子电荷加在哪里比较合适呢?需要均匀分布吗?还是加在其中一个原子上?
作者
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bobosiji    时间: 2021-3-9 08:53
邱美佳 发表于 2021-3-8 20:13
请问原子电荷加在哪里比较合适呢?需要均匀分布吗?还是加在其中一个原子上?

均匀分布在表面的原子上?内部原子可以加电荷么?记得内部电势应该是0来着?
作者
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cheviax    时间: 2021-3-9 10:55
邱美佳 发表于 2021-3-8 20:13
请问原子电荷加在哪里比较合适呢?需要均匀分布吗?还是加在其中一个原子上?

一般是均匀加在表面的原子上
作者
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邱美佳    时间: 2021-3-9 11:05
cheviax 发表于 2021-3-9 10:55
一般是均匀加在表面的原子上

好的,非常感谢!




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