计算化学公社

标题: GGA无法成功优化金属表面的一个分子 [打印本页]

作者
Author:
Sinddo    时间: 2021-3-9 09:20
标题: GGA无法成功优化金属表面的一个分子
楼主现在正在算一个分子在金属表面的吸附,在高斯中(PBE1PBE-D3/def2TZVP)优化出了五种该分子的不同稳定构型。将优化后的分子构象放到一个盒子里面用VASP结构优化(PAW-PBE)计算能量来算吸附能。前面四种构型都很快收敛了,结构仅有细微调整。而最后一种构型分子直接跑散了,后来楼主又调整了分子构型,一直不能够成功。老板让换个泛函试试,于是又试了PW91还是和PBE一样的结果,但是LDA可以优化出这种构型,没有跑散,用PBE在金属表面优化也不会跑散。想问下这种情况大家有遇到吗,是怎么处理的?
INCAR文件如下:

ENCUT  =  500        (Cut-off energy for plane wave basis set, in eV)
ISMEAR =  0            (Gaussian smearing; metals:1)
SIGMA  =  0.01         (Smearing value in eV; metals:0.2)
EDIFF  =  1E-05        (SCF energy convergence; in eV)
NSW    =  500          (Max ionic steps)
IBRION =  2            (Algorithm: 0-MD; 1-Quasi-New; 2-CG)
POTIM =0.1
ALGO = Fast
EDIFFG = -0.01        (Ionic convergence; eV/AA)
LREAL = Auto
ISIF = 2
LWAVE = .FALSE.
LCHARG = .FALSE.
NWRITE = 1
IVDW = 12
NPAR = 2



作者
Author:
卡开发发    时间: 2021-3-9 09:25
本帖最后由 卡开发发 于 2021-3-9 09:27 编辑

整个结构驰豫过程是否每一步电子步都是收敛的?以及晶格尺寸是否充分大?实在不行可以用单点做个能量、力随盒子的变化看看。
作者
Author:
Sinddo    时间: 2021-3-9 09:25
盒子大小建立的30×30×30,如果仅用vasp(PBE)计算单点能,前四种构型均为235.xxx eV,而最后这种构型只有201 eV,明显小于前面几种构型。难道是因为在这种方法的势能面上这个构型附近没有极小点?
作者
Author:
Sinddo    时间: 2021-3-9 09:32
卡开发发 发表于 2021-3-9 09:25
整个结构驰豫过程是否每一步电子步都是收敛的?以及晶格尺寸是否充分大?实在不行可以用单点做个能量、力随 ...

可以收敛,但是和其他四种构型相比,明显每一离子步都需要很多电子步才可以收敛。晶格尺寸应该足够大了,一开始设置的20×20×20的,后来上升至30×30×30,其单点能均和其他构型相比有较大差距,前面四种均为235.xxx eV,这一种只有201 eV。想问下老师这种情况是否因为在该方法下,这个构型势能面附近就没有极小点?
作者
Author:
卡开发发    时间: 2021-3-9 09:41
Sinddo 发表于 2021-3-9 09:32
可以收敛,但是和其他四种构型相比,明显每一离子步都需要很多电子步才可以收敛。晶格尺寸应该足够大了, ...

要不输入文件打包过来看看(包括POTCAR),有时间我测试下,仅凭借INCAR很难判断出问题。
作者
Author:
Sinddo    时间: 2021-3-9 09:50
卡开发发 发表于 2021-3-9 09:41
要不输入文件打包过来看看(包括POTCAR),有时间我测试下,仅凭借INCAR很难判断出问题。

INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS 已打包,感谢老师帮助!

作者
Author:
devinhu    时间: 2021-3-9 12:33
本帖最后由 devinhu 于 2021-3-9 12:34 编辑

POSCAR和POTCAR中元素对应不上来POSCAR: O C H
POTCAR:   H C O

作者
Author:
Sinddo    时间: 2021-3-9 15:03
devinhu 发表于 2021-3-9 12:33
POSCAR和POTCAR中元素对应不上来POSCAR: O C H
POTCAR:   H C O

问题确实出在这里!回想起中途改了POSCAR,想着元素没变就没有更改POTCAR,不曾想着POSCAR里元素顺序变了,十分感谢!
作者
Author:
Sinddo    时间: 2021-3-9 15:04
卡开发发 发表于 2021-3-9 09:41
要不输入文件打包过来看看(包括POTCAR),有时间我测试下,仅凭借INCAR很难判断出问题。

老师,问题解决了,是POSCAR和POTCAR元素顺序没有对应




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3