计算化学公社

标题: 求助高斯NMR自旋耦合常数的计算 [打印本页]

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Author: 风飞 时间: 2015-11-20 19:23
标题: 求助高斯NMR自旋耦合常数的计算
老师：您好！请问怎样看高斯计算NMR自旋耦合常数的输出文件？或者请问您是否有关于NMR的帖子？我想拜读一下，谢谢！

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Author: liyuanhe211 时间: 2015-11-20 22:56
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-11-20 22:59 编辑

打开看，J-J coupling constant都以两两原子间列表的形式列在里面。
印象中10.1021/jo501781b这篇文献的SI里似乎直接教你怎么算，给出了输入和输出案例（对输出略有修改，但容易类比理解），但是现在学校的部分IP被ACS临时封了，没法确认，笔记上只留了一个截图，你可以下下来看一下。

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作者
Author: sobereva 时间: 2015-11-21 01:43
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输出的J矩阵的(i,j)矩阵元就是i,j两个原子间的核自旋-自旋耦合常数。

作者
Author: 风飞 时间: 2015-11-21 14:13
谢谢老师！@sobereva @liyuanhe211

作者
Author: 风飞 时间: 2015-11-21 15:28
本帖最后由风飞于 2015-11-21 16:31 编辑

风飞发表于 2015-11-21 14:13
谢谢老师！@sobereva @liyuanhe211

老师：您好！我还有几个疑问：1）您说高斯中默认的N的是N14，那请问B，H, C 的同位素分别是多少呢？2）对于输出文件的耦合常数有很多种，我们是不是只读取费米耦合常数，还是读最后的总的核自旋耦合常数？（要用于和实验做比较）

作者
Author: sobereva 时间: 2015-11-21 21:14

风飞发表于 2015-11-21 15:28
老师：您好！我还有几个疑问：1）您说高斯中默认的N的是N14，那请问B，H, C 的同位素分别是多少呢？2） ...

读取总的
同位素是多少当你用了#P的时候输出文件一开始就显示了

作者
Author: vangogh 时间: 2015-11-22 10:07
各位老师，2楼第一部分是计算结构，第二部分算NMR，第三部分算J，输入文件最后几行是啥意思，文中说的DU4是啥，我还是看不大明白，可否解释下第三部分？

作者
Author: quora 时间: 2017-7-14 01:11
看了sob老师和Dr. Li的回帖，我明白了如何计算耦合常数J，但是还不清楚如何看计算结果，比如结果中J = 0.341108D+02 这个如何转为实际的数值，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2017-7-14 10:10

quora 发表于 2017-7-14 01:11
看了sob老师和Dr. Li的回帖，我明白了如何计算耦合常数J，但是还不清楚如何看计算结果，比如结果中J = 0.3 ...

0.341108D+02 = 34.1108

作者
Author: quora 时间: 2017-7-14 10:39

sobereva 发表于 2017-7-14 10:10
0.341108D+02 = 34.1108

谢谢您！但是341108D+02 = 34.1108 ，34HZ的耦合常数太大，是不是还要转换一下才了可以呢？那如何转换啊，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2017-7-14 10:43

quora 发表于 2017-7-14 10:39
谢谢您！但是341108D+02 = 34.1108 ，34HZ的耦合常数太大，是不是还要转换一下才了可以呢？那如何转换啊 ...

不需要转换，参考例子
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Author: quora 时间: 2017-7-14 10:48

sobereva 发表于 2017-7-14 10:43
不需要转换，参考例子

谢谢sob老师，明白了

作者
Author: qcn 时间: 2017-8-19 22:43
请问sob老师，计算耦合常数用什么泛函较好？基组的iglo和pcj序列哪些是高斯内置的？哪些泛函和基组您觉得计算结果还不错？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-19 23:36

qcn 发表于 2017-8-19 22:43
请问sob老师，计算耦合常数用什么泛函较好？基组的iglo和pcj序列哪些是高斯内置的？哪些泛函和基组您觉得计 ...

B3LYP就可以。用B97-2或者KT1可能更好些。
推荐pc-J
是否高斯内置的看手册便知。

作者
Author: qcn 时间: 2017-8-20 10:24
谢谢Sob老师的回复

作者
Author: 381911577 时间: 2020-5-17 21:48
老师，我用NMR=spinspin关键词计算耦合常数，计算了很久。我打开还没计算完的log文件，里面有Isotropic这一栏。这个关键词是先计算化学位移，在计算耦合常数吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-21 08:17

381911577 发表于 2020-5-17 21:48
老师，我用NMR=spinspin关键词计算耦合常数，计算了很久。我打开还没计算完的log文件，里面有Isotropic这 ...

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