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标题: Sob老师，请问这个link die 2070了，但是找不到错误怎么办 [打印本页]

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Author: 一击男19 时间: 2021-3-10 17:43
标题: Sob老师，请问这个link die 2070了，但是找不到错误怎么办
Sob老师，附件是我第二次优化之后进行频率计算报错，但也没有Error提示。其实第一次优化+频率时也是相同的情况，我估计是容量不够了（我看剩余内存见红了），然后我单独提取优化后的文件进行频率计算，把%mem提高了一倍并清除了之前的一些运行内存，但还是相同的link die。不知道怎么回事，请问应该怎么办呢？是基组选取问题么？

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Author: wzkchem5 时间: 2021-3-10 18:28
这个体系太大了，频率算不动是正常的。实在不行可以尝试用数值频率。
另外我猜这个体系实际上应该在溶液或者至少是液相里吧？那样的话应该加溶剂模型。另外搭建的结构严重不合理，有好几个Al原子有空配位点没有饱和，另外有两个Si-O键直接指向N原子且快要成键了，这也很奇怪，我不相信这是你摆这个体系的本意。如果你要研究的主要是Al、N团簇那边的行为的话，离团簇特别远的基团可以用H代替，节省计算量，或者用ONIOM近似处理。这个体系明显会有很多溶剂分子穿插在你的有机分子的空隙里，你没有描述那些溶剂分子的话，把有机分子描述得那么细致，对于精度根本没有用。

作者
Author: 一击男19 时间: 2021-3-10 18:42

wzkchem5 发表于 2021-3-10 18:28
这个体系太大了，频率算不动是正常的。实在不行可以尝试用数值频率。
另外我猜这个体系实际上应该在溶液或 ...

感谢您的回复，请问数值频率应该怎么计算呢？确实这个优化后的成键模式很迷，很多我也搞得迷迷糊糊的了，其实我这个模型是环氧单体+固化剂单体，外加硅烷修饰的AlN单体。但是优化后我都不认识它了。ε=(′ο｀*)))唉

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-3-10 21:38

一击男19 发表于 2021-3-10 18:42
感谢您的回复，请问数值频率应该怎么计算呢？确实这个优化后的成键模式很迷，很多我也搞得迷迷糊糊的了， ...

我觉得你再查一下你的AlN单体的具体结构，包括表面上哪些地方和溶剂配位也要搞清楚。我觉得是你有的地方少画了配位的溶剂。
数值频率就把freq改成freq=numer就行了。数值频率会慢好多倍，而且会引入少许误差，但是消耗内存少得多。如果决定用数值频率，那么同一个工作里的所有物种都要用数值频率，以求Gibbs自由能相减的时候误差抵消

作者
Author: 一击男19 时间: 2021-3-10 22:06

wzkchem5 发表于 2021-3-10 21:38
我觉得你再查一下你的AlN单体的具体结构，包括表面上哪些地方和溶剂配位也要搞清楚。我觉得是你有的地方 ...

好的，十分谢谢，我试试看~

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-11 02:12
末尾提示 g_write，明显硬盘不够

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这么大体系数值频率几乎没希望

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Author: 一击男19 时间: 2021-3-11 09:04

sobereva 发表于 2021-3-11 02:12
末尾提示 g_write，明显硬盘不够

那唯一的方法是不是只能换一个电脑了呢？

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Author: sobereva 时间: 2021-3-12 01:55

一击男19 发表于 2021-3-11 09:04
那唯一的方法是不是只能换一个电脑了呢？

ppt里不都写了么

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Author: 一击男19 时间: 2021-3-12 08:15

sobereva 发表于 2021-3-12 01:55
ppt里不都写了么

好的，谢谢sob老师

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