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标题: 求助：蛋白-蛋白进行完mmpbsa分析后如何进行丙氨酸扫描？ [打印本页]

作者
Author: Anguria 时间: 2021-3-12 13:30
标题: 求助：蛋白-蛋白进行完mmpbsa分析后如何进行丙氨酸扫描？
蛋白-蛋白进行完mmpbsa分析后，老师要让做丙氨酸突变，但是我不知道该选择哪个氨基酸残基进行突变，是随机选择还是确定结合位点的氨基酸再进行突变？但是也不知道怎么知道氨基酸残基的对结合贡献情况。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-13 06:08
既然是你导师让做的，这种事应该问你导师，对当前体系情况比别人了解得更清楚

如果目的是考察某个关键残基对结合能的影响，就对这个残基进行丙氨酸突变。可以根据结构图肉眼判断哪些残基对结合影响较大，也可以对mmpbsa做能量分解简单考察一下各个残基的贡献

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