计算化学公社

标题: 氢键和阳离子-π结构优化求助 [打印本页]

作者
Author: 阿社社社 时间: 2021-3-13 09:35
标题: 氢键和阳离子-π结构优化求助
各位老师好，根据文献想优化一个存在氢键和阳离子-π结构分子，如下图文献结构所示。但是我优化后氢氧根离子与相邻氢原子生成水分子，并且靠近阳离子（我猜是更大离子键的强度趋势两个部分靠在一起），尝试各种初猜结构都如此，请问有什么好的解决办法吗，方法用的B3LYP/6-31++g(d,p)。
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作者
Author: alonewolfyang 时间: 2021-3-13 10:22
试试固定电荷去优化？

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2021-3-13 10:38
用B3LYP泛函优化这种体系完全是扯淡
仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的 http://sobereva.com/557

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-14 02:31
这种局部显著带电的情况，溶剂效应绝对不能忽视，对离子性物质有极大的稳定化作用。气相下得到你的结果没什么意外的

没事甭给氢加弥散
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119
这么点体系用6-311+G**好得多

虽然此体系是静电作用为主，B3LYP不是必须加色散校正，但不加很容易挨审稿人批
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobereva.com/413（http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html）
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

作者
Author: 阿社社社 时间: 2021-3-14 17:11
感谢sob老师和陶老师的回复，我重新优化用的M062X-d3，但结果和帖子中的结果差不多。后面发现是文献中的结构的需要带一个正电荷（Na+，OH-，H+），和一个单电子（图上有个e-），设置为输入文件1 2后才能优化到文献中的结构。

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