计算化学公社

标题: 在利用cp2k练习cp2k官网提供的练习时出现Cholesky decomposition failed报错 [打印本页]

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Author: 心羽1971411 时间: 2021-3-13 15:33
标题: 在利用cp2k练习cp2k官网提供的练习时出现Cholesky decomposition failed报错
本帖最后由心羽1971411 于 2021-3-14 09:11 编辑

各位好，为了计算熔盐体系Raman光谱，我刚刚开始学习cp2k，编译后的cp2k在运行社长“CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法”一文中提供的测试案例时没有问题。但是在练习官网上提供的“How to calculate vibrational spectra from AIMD with CP2K and TRAVIS (Updated 2018)”时，总是报"Cholesky decomposition failed"错误，我使用的输入文件为官网上下载的输入文件，即下文的a2.txt，得到的输出文件为a2.out，我输入的指令为mpirun --allow-run-as-root -np 12 cp2k.popt a2.txt |tee a2.out ,请问这个是不是我输入的问题？应该如何解决？另外我上传了我虚拟机的设置截图，How to calculate vibrational spectra from AIMD with CP2K and TRAVIS 教程内讲光谱计算动不动就要好几周，请问我这样设置虚拟机能够计算熔盐光谱吗？昨天因为附件中因为没有包含被include的文件，今个添加了此文件。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-14 02:49
被include的文件也不给，别人都没法给你测试

作者
Author: 心羽1971411 时间: 2021-3-14 09:13

sobereva 发表于 2021-3-14 02:49
被include的文件也不给，别人都没法给你测试

老师，我添加了被include的文件，不知这样还缺不缺文件？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-15 04:23
我这里跑了几步，没任何问题
(, 下载次数 Times of downloads: 48)

用的是下文编译的popt版，CP2K 8.1，系统CentOS 8 Stream
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html）

作者
Author: 心羽1971411 时间: 2021-3-17 10:31

sobereva 发表于 2021-3-15 04:23
我这里跑了几步，没任何问题

老师，我又重新运行了几次，可是还是报错。系统是在vmware上安装的centos8.3,使用的cp2k8.1，编译过程是按照您上文的帖子编译的。输入、输出文件以及我在终端输入的指令如下截图和附件。老师请问这是为什么？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-18 05:23

心羽1971411 发表于 2021-3-17 10:31
老师，我又重新运行了几次，可是还是报错。系统是在vmware上安装的centos8.3,使用的cp2k8.1，编译过程是 ...

跑此文里Multiwfn创建的各种CP2K输入文件有无问题？
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587（http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html）

官方预编译版跑有无问题？

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Author: 心羽1971411 时间: 2021-3-19 14:43

sobereva 发表于 2021-3-18 05:23
跑此文里Multiwfn创建的各种CP2K输入文件有无问题？
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
ht ...

老师，我使用cp2k.popt测试了Multiwfn的文件，可以运行；在使用cp2k.ssmp运行我上面发的输入文件时可以运行，但是使用cp2k.popt计算时还是报Cholesky decomposition failed.Matrix ill conditioned?

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-19 14:45

心羽1971411 发表于 2021-3-19 14:43
老师，我使用cp2k.popt测试了Multiwfn的文件，可以运行；在使用cp2k.ssmp运行我上面发的输入文件时可以运 ...

干脆直接用Multiwfn生成一个CP2K跑动力学的输入文件，甭用教程提供的。我这里没法重复出你的问题也没法给你具体说。

作者
Author: 心羽1971411 时间: 2021-3-19 15:37

sobereva 发表于 2021-3-19 14:45
干脆直接用Multiwfn生成一个CP2K跑动力学的输入文件，甭用教程提供的。我这里没法重复出你的问题也没法给 ...

好的，谢谢老师。

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