计算化学公社

标题: 求助：关于晶胞优化和结构优化的问题 [打印本页]

作者
Author: anrushan 时间: 2021-3-14 20:54
标题: 求助：关于晶胞优化和结构优化的问题
各位老师好，我最近在看一些关于CP2K分子动力学的文章，有一些文章在计算分子动力学时只使用了结构优化，而一些文章内结构优化和晶胞优化都进行了，请问各位老师晶胞优化是否是必须的，如果不优化会有什么问题呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-15 04:27
动力学和结构优化是两码事，不知道你具体问哪一步

作者
Author: anrushan 时间: 2021-3-15 10:19

sobereva 发表于 2021-3-15 04:27
动力学和结构优化是两码事，不知道你具体问哪一步

卢老师您好，我想问的是在分子动力学之前需要对所构建的周期盒子用CP2K进行优化，在这一步优化中有些文献里只进行了结构优化（BFGS方法），而有些文献中使用了晶胞优化（晶胞优化CG和结构优化BFGS）,我不明白为什么会有这种差异，如果只进行结构优化会对之后的分子动力学计算会有什么影响，或者说晶胞优化的意义是什么呢。

作者
Author: anrushan 时间: 2021-3-15 18:53

sobereva 发表于 2021-3-15 04:27
动力学和结构优化是两码事，不知道你具体问哪一步

还有一个问题，卢老师，对于单物质建成的盒子，同样也需要进行晶胞优化吗，晶胞优化是否对单物质盒子而言是鸡肋呢？如果只进行几何优化对后续计算精度是否有影响呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-16 07:06

anrushan 发表于 2021-3-15 10:19
卢老师您好，我想问的是在分子动力学之前需要对所构建的周期盒子用CP2K进行优化，在这一步优化中有些文献 ...

只要动力学能正常跑起来就不需要优化。优化的目的是为了消除初始结构可能存在的不合理接触导致动力学一开始崩溃，只要你的初始结构足够好就没必要优化。这和是不是单质没有直接联系。

是否对晶胞也优化不是什么重要问题

作者
Author: anrushan 时间: 2021-3-16 07:59

sobereva 发表于 2021-3-16 07:06
只要动力学能正常跑起来就不需要优化。优化的目的是为了消除初始结构可能存在的不合理接触导致动力学一开 ...

明白了，谢谢卢老师

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