计算化学公社

标题: 求助关于磷脂膜加水的问题 [打印本页]

作者
Author:
gmx-xx    时间: 2021-3-15 10:44
标题: 求助关于磷脂膜加水的问题
各位老师好,请问我在用Sob老师的genmixmen建膜程序后,如何向两端加入水分子呢?是直接用gmx solvate命令吗?还是用其他方法?
还有一个问题就是sob老师说如果怕水跑到磷脂里面,就在Z方向上加入一个限制势,这一部是如何加啊?是在pull.mdp文件中加入吗?
谢谢各位老师

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-3-16 05:53
用gmx solvate

在.top里加
(, 下载次数 Times of downloads: 35)






欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3