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标题: 重复sob老师“使用multiwfn+VMD绘制分子范德华表面图”遇到问题 [打印本页]

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Author: lunaishere 时间: 2021-3-15 14:58
标题: 重复sob老师“使用multiwfn+VMD绘制分子范德华表面图”遇到问题
我是使用multiwfn3.7和VMD1.9.4，想重复sob老师在sobereva.com/443一文中绘制分子范德华表面的方法，准备工作的一系列我文件确实是对着B站的教程视频做的，但是到了打开VMD，输入pt指令的时候，就出现无法读取ESPpt.vmd，ESPiso.vmd也是这样的情况，请教各位大神这是怎么回事呢？

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Author: lyj714 时间: 2021-3-15 17:15
本帖最后由 lyj714 于 2021-3-15 17:21 编辑

看清楚提示的是什么东西，明显找不到这个文件。需要把Multiwn 路径下的 \examples\drawESP下的脚本复制出来到当前工作路径下的。
不是vmd版本问题，亲测vmd1.9.4可用。
Tips:
推荐把vmd添加到系统环境变量Path下，然后直接cmd命令行使用（这样可以在任意工作目录下直接按住shift + 鼠标右键进cmd）

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Author: sobereva 时间: 2021-3-15 17:48
VMD命令行窗口里输入pwd，看当前路径是什么。EPSiso.vmd必须放到当前目录下

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-15 21:34
本帖最后由 lunaishere 于 2021-3-15 21:35 编辑

sobereva 发表于 2021-3-15 17:48
VMD命令行窗口里输入pwd，看当前路径是什么。EPSiso.vmd必须放到当前目录下

谢谢老师，我按照这个步骤，查看当前路径为D:\VMD\VMD，那5个.vmd文件是放入这个路径下的D:\桌面\1.png

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Author: lunaishere 时间: 2021-3-15 21:51

lyj714 发表于 2021-3-15 17:15
看清楚提示的是什么东西，明显找不到这个文件。需要把Multiwn 路径下的 \examples\drawESP下的脚本复制出来 ...

嗯嗯，大神，我是将.vmd的文件放在VMD的路径里面的。但是因为我在官网下载的vmd安装完了之后，每次运行就只有命令那个窗口出来，main窗口不显示的，而且那个命令窗口几秒之后也会闪退。我不晓得是怎么了，就在量化的论坛这里找到一位大神自己编译了的VMD安装包，安装之后运行正常的，但是没能做出来sob老师教程中的这个例子

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-16 07:03

lunaishere 发表于 2021-3-15 21:34
谢谢老师，我按照这个步骤，查看当前路径为D:\VMD\VMD，那5个.vmd文件是放入这个路径下的

把vmd.rc里ESPiso.vmd文件名改为D:/VMD/VMD/ESPiso.vmd再试

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 09:27

sobereva 发表于 2021-3-16 07:03
把vmd.rc里ESPiso.vmd文件名改为D:/VMD/VMD/ESPiso.vmd再试

老师，我将vmd.rc文件中文件名前面加了路径，还是不能成。
而且我看到我的vmd.rc文件跟您演示视频里的不太一样

作者
Author: lyj714 时间: 2021-3-16 09:41

lunaishere 发表于 2021-3-16 09:27
老师，我将vmd.rc文件中文件名前面加了路径，还是不能成。
而且我看到我的vmd.rc文件跟您演示视频里的不 ...

Windows下的路径用\\啊，基本常识。其他不管，那个设置都是自己偏好设置的

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 15:11

lyj714 发表于 2021-3-16 09:41
Windows下的路径用\\啊，基本常识。其他不管，那个设置都是自己偏好设置的

抱歉，原谅我真的是没有基础，计算机水平不行。大佬，路径我改成\\也不能成

作者
Author: lyj714 时间: 2021-3-16 15:22
本帖最后由 lyj714 于 2021-3-16 15:23 编辑

lunaishere 发表于 2021-3-16 15:11
抱歉，原谅我真的是没有基础，计算机水平不行。大佬，路径我改成\\也不能成

报啥错误呀？截图说明，还有就是最好不要一个电脑上装多个vmd，这样避免一些环境变量可能混淆。

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Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 15:45

lyj714 发表于 2021-3-16 15:22
报啥错误呀？截图说明，还有就是最好不要一个电脑上装多个vmd，这样避免一些环境变量可能混淆。

路径我试过\; \\，其实我直接复制出来的路径是单\。报错如图，您看看

作者
Author: lyj714 时间: 2021-3-16 15:56
本帖最后由 lyj714 于 2021-3-16 16:04 编辑

lunaishere 发表于 2021-3-16 15:45
路径我试过\; \\，其实我直接复制出来的路径是单\。报错如图，您看看

我怀疑你到底启动的是不是更改vmd.rc这个路径下的vmd.exe，如果是不可能连定义的命令都执行不了。我说了一个电脑不要装多个vmd，你这种绝对是几个之间弄混了。tcl环境下路径设置/和\\是等价的，用\是错的

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 16:10

lyj714 发表于 2021-3-16 15:56
我怀疑你到底启动的是不是更改vmd.rc这个路径下的vmd.exe，如果是不可能连定义的命令都执行不了。我说了 ...

我是把其他vmd都卸载掉了，目前只有一个版本的vmd了。启动vmd是在文件夹中的那个vmd.exe启动的，修改的也是这个文件夹中的vmd.rc

作者
Author: lyj714 时间: 2021-3-16 16:31
本帖最后由 lyj714 于 2021-3-16 16:32 编辑

lunaishere 发表于 2021-3-16 16:10
我是把其他vmd都卸载掉了，目前只有一个版本的vmd了。启动vmd是在文件夹中的那个vmd.exe启动的，修改的也 ...

那这可真是太奇怪了，如果你的vmd1.9.4a来自论坛发布的那款不应该出现这种情况。
我发个视频链接看我操作，直接从桌面图标启动就可以，pdb文件也要放到桌面上
视频演示

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 16:35

lyj714 发表于 2021-3-16 16:31
那这可真是太奇怪了，如果你的vmd1.9.4a来自论坛发布的那款不应该出现这种情况。
我发个视频链接看我操 ...

感谢老师，我在再对着视频尝试几次，泪目了，我搞了4天这个也没弄成：(

作者
Author: lyj714 时间: 2021-3-16 16:39

lunaishere 发表于 2021-3-16 16:35
感谢老师，我在再对着视频尝试几次，泪目了，我搞了4天这个也没弄成：(

你看看你上一张截图vmd.rc修改时间，明显你没有最近更改过啊。 (, 下载次数 Times of downloads: 46)

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 16:47

lyj714 发表于 2021-3-16 16:39
你看看你上一张截图vmd.rc修改时间，明显你没有最近更改过啊。

啊，是哦，但是我打开之后是加入了那几行命令的，老师我再去查看一下，谢谢您

作者
Author: lunaishere 时间: 2021-3-16 18:59

lyj714 发表于 2021-3-16 16:39
你看看你上一张截图vmd.rc修改时间，明显你没有最近更改过啊。

真的是哦老师，我用的sublime text, 修改之后必须要点一次保存，更改了这个就成了。太感谢您啦！真是被自己蠢哭 T T

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