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标题: 请教RDG散点图的spike点与AIM分析的键临界点rho值对应的问题 [打印本页]

作者
Author: 运气加持 时间: 2021-3-17 22:14
标题: 请教RDG散点图的spike点与AIM分析的键临界点rho值对应的问题
请教大家：我对于RDG散点图的理解是spike点对应的rho值要与键临界点的一致。通过AIM分析计算出来的氢键的某个键临界点的Density of all electrons值为0.018，但是RDG分析的散点图即使选择了高质量格点进行计算，在-0.018附近位置也没有spike点，这两者是否矛盾？这是什么原因造成的呢，与我的体系大小是否有关系（我的体系原子数很多）？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-18 05:12
在出现临界点的地方用很密的格点绝对会出现spike

此文Q39明确说了，此语境下high quality grid定义了总的格点数，体系越大格点间距就越大、等效格点质量就越低
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

(2)格点间距或格点数。格点间距直接决定分析质量，而计算耗时正比于格点数。当盒子尺寸是确定的时候，显然格点间距越小则格点数越多，反之亦然。用户应当恰当设定格点间距或格点数达到分析结果质量和耗时的权衡。Multiwfn设定格点的界面里有low/medium/high quality grid选项，对于不同功能的定义是不同的，看屏幕上的具体提示，有时对应的是总格点数，有时对应的是格点间距。对于设置的是总格点数的时候，注意low/medium/high这三个词只是对于小体系而言的，如果是很大的体系，由于盒子大了，哪怕是medium quality grid格点数的格点间距也会很大，因此实际上得到的结果是很糙的，此时得用high quality grid或者用手动输入格点间距的模式手动输入格点间距。

作者
Author: 运气加持 时间: 2021-3-24 21:07

sobereva 发表于 2021-3-18 05:12
在出现临界点的地方用很密的格点绝对会出现spike

此文Q39明确说了，此语境下high quality grid定义了总 ...

谢谢老师解答，我还想问下，设置小的格点间距得到的点是否一定会包含大的格点间距的结果？感觉我用“Grid spacing in X,Y,Z is 0.265347 0.265347 0.265347 Bohr” 计算得到的一部分点没有出现“ Grid spacing in X,Y,Z is 0.24 0.24 0.24 Bohr”的结果中。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-25 07:09

运气加持发表于 2021-3-24 21:07
谢谢老师解答，我还想问下，设置小的格点间距得到的点是否一定会包含大的格点间距的结果？感觉我用“Grid ...

显然不是
只有二者呈倍数关系才能确保较小格点间距时也正好能占较大格点间距时的点

作者
Author: 运气加持 时间: 2021-3-25 10:34

sobereva 发表于 2021-3-25 07:09
显然不是
只有二者呈倍数关系才能确保较小格点间距时也正好能占较大格点间距时的点

明白了，感谢老师

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