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标题: 求助运行Gromacs需要的电脑配置 [打印本页]

作者
Author: ScarlettRay 时间: 2021-3-25 19:22
标题: 求助运行Gromacs需要的电脑配置
我这边需要做的计算是DNA分子、蛋白质与化合物的动力学仿真过程。DNA分子大概约有20--30个碱基对的长度。蛋白质也是比较常见的干扰素。这边的化合物有二元如铋硒，也有四元化合物。这边对电脑的要求高吗？大概有什么要求呢？麻烦各位老师了！！！

作者
Author: ScarlettRay 时间: 2021-3-25 19:45
找到了老师之前发的帖子，是我唐突啦。谢谢各位老师啦。

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-25 19:47
本帖最后由 hdhxx123 于 2021-3-25 19:49 编辑

http://sobereva.com/444
往下拉有GPU加速的动力学配置，上面有量子化学的机器配置推荐，建议两个都参考，不耽误做AIMD，DFT和GROMACS计算你这个体系可以选择做QM/MM，xtb动力学以及GROMACS等分子动力学，看你需要，做DFT也能做得动

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-25 20:06
注意搞计算化学的人说“模拟”不说“仿真”

这种大小体系一万块钱弄个6核机子加个高端GPU就非常理想了

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-3-25 20:50
按一年前的GPU价格，一台机子5000就理想了

作者
Author: ScarlettRay 时间: 2021-5-7 16:14

sobereva 发表于 2021-3-25 20:06
注意搞计算化学的人说“模拟”不说“仿真”

这种大小体系一万块钱弄个6核机子加个高端GPU就非常理想了

知道了，谢谢老师提醒。

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