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标题: 求助：关于利用NPT求体系密度。 [打印本页]

作者
Author: ocbrother 时间: 2021-3-26 09:55
标题: 求助：关于利用NPT求体系密度。
各位老师，我是研究水环境下有机小分子在金属表面吸附的。在论坛看到说要在跑最后的MD之前，需要用NPT来求出体系的密度。我是利用MS的build layer将金属表面层和含有有机小分子的水溶液叠起来。
请问，利用NPT求的密度是含有金属表面层的整个体系还是只对含有机小分子的这一层求密度？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-26 10:18
不需要求出密度，你本来也不需要密度值。要求在于让密度已经平衡了

作者
Author: ocbrother 时间: 2021-3-26 10:39

sobereva 发表于 2021-3-26 10:18
不需要求出密度，你本来也不需要密度值。要求在于让密度已经平衡了

谢谢sob老师的帮助。
老师的意思就是把整个模拟体系构建出来并几何优化后，直接上NPT就完事呗

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-26 12:01

ocbrother 发表于 2021-3-26 10:39
谢谢sob老师的帮助。
老师的意思就是把整个模拟体系构建出来并几何优化后，直接上NPT就完事呗

是

作者
Author: ocbrother 时间: 2021-3-26 14:00

sobereva 发表于 2021-3-26 12:01
是

收到。谢谢老师

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