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标题: 求助算rdf判断两个分子的混合能力 [打印本页]

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gmx-xx    时间: 2021-3-26 16:35
标题: 求助算rdf判断两个分子的混合能力
请问各位老师:如果用算两个分子的径向分布函数来判断它们的混合能力,盒子中应该分别放这两个分子多少个啊?谢谢大家

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k64_cc    时间: 2021-3-26 17:06
正常人研究混合能力都直接看密度……
作者
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gmx-xx    时间: 2021-3-26 18:54
您好 请问怎么看密度啊 用哪个板块啊
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sobereva    时间: 2021-3-26 19:22
分子什么特征都不说,谁也没法告诉你至少放多少合适

判断混合能力有的是其它更好的做法,诸如平均每个A类分子附近B类数目
作者
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gmx-xx    时间: 2021-3-26 19:50
sobereva 发表于 2021-3-26 19:22
分子什么特征都不说,谁也没法告诉你至少放多少合适

判断混合能力有的是其它更好的做法,诸如平均每个A ...

老师 我想考察的事 磷脂包裹药物分子的能力  
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xxzj    时间: 2022-2-27 16:48
sobereva 发表于 2021-3-26 19:22
分子什么特征都不说,谁也没法告诉你至少放多少合适

判断混合能力有的是其它更好的做法,诸如平均每个A ...

老师,想请问您,判断混合能力可以通过计算平均每个A类分子附件B类数目,想向老师请教一下,这个功能如何实现?
作者
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sobereva    时间: 2022-2-28 13:49
xxzj 发表于 2022-2-27 16:48
老师,想请问您,判断混合能力可以通过计算平均每个A类分子附件B类数目,想向老师请教一下,这个功能如何 ...

自己写个VMD tcl脚本,循环每个A分子,利用within选择语句计算每个A分子附近B的数目,然后取平均

选择语句看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html




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