计算化学公社

标题: 反应复合物优化后结果变成产物 [打印本页]

作者
Author: clark_yang 时间: 2021-3-26 17:59
标题: 反应复合物优化后结果变成产物
各位老师好，本人在优化反应复合物时（IRC跑完后，取反应物端），总是出现优化后直接得到产物，是不是意味着没有中间复合物？虽然在群里咨询了卢老师，但还是没有弄明白，到底如何确定复合物的存在，在论坛里搜了半天也没有找到答案，先谢谢各位了！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-3-26 18:27
IRC有一个峰，说明这个反应还是有势垒的，优化得到产物可能是因为优化步长太大，步子迈太大直接跨过势垒了。可以减小优化步长试试

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-3-26 18:29
不过也不排除这个反应有两条途径，一条没有势垒的，一条有势垒的，你的IRC对应的是后者，优化反应复合物时沿着前者变成了产物。总之先试试减小优化步长再看

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-26 19:26
我不记得你有问过我

减小步长上限

作者
Author: clark_yang 时间: 2021-3-27 12:32

sobereva 发表于 2021-3-26 19:26
我不记得你有问过我

减小步长上限

嗯，确实请教过您，正在减小步长尝试，同时，另外有个问题，若是加成反应，产物方向应该是没有复合物？还是仍有复合物？按照逻辑，最终产物应该是势能面最低点，不知道理解的对不对？

作者
Author: clark_yang 时间: 2021-3-27 12:48

wzkchem5 发表于 2021-3-26 18:29
不过也不排除这个反应有两条途径，一条没有势垒的，一条有势垒的，你的IRC对应的是后者，优化反应复合物时 ...

多谢，正在尝试！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-28 10:36

clark_yang 发表于 2021-3-27 12:32
嗯，确实请教过您，正在减小步长尝试，同时，另外有个问题，若是加成反应，产物方向应该是没有复合物？还 ...

产物如果是单分子当然没有复合物

作者
Author: clark_yang 时间: 2021-3-28 16:28

sobereva 发表于 2021-3-28 10:36
产物如果是单分子当然没有复合物

好的。卢老师，减少步长没有用，后面发现您回复别人一个帖子说用相同方法优化，所以我采用了和irc相同的方法优化，结果可以了，谢谢您！irc用的是b3lyp，复合物用M062x不行，总是优化到产物了，继续用b3lyp就可以了，写出来是希望别人出现同类型问题时好解决，最后感谢上面所有回复的老师！，

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-28 23:01

clark_yang 发表于 2021-3-28 16:28
好的。卢老师，减少步长没有用，后面发现您回复别人一个帖子说用相同方法优化，所以我采用了和irc相同的 ...

跑IRC和优化过渡态要用同一级别这是基本常识。如果优化过渡态和优化极小点都不在一个级别，就属于低级错误了，完全发不了文章

作者
Author: clark_yang 时间: 2021-3-29 12:01

sobereva 发表于 2021-3-28 23:01
跑IRC和优化过渡态要用同一级别这是基本常识。如果优化过渡态和优化极小点都不在一个级别，就属于低级错 ...

跑IRC和过渡态是同一级别进行的，反应复合物和产物复合物同样也要在一个级别么？这个问题还真没注意，非常抱歉。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-29 18:03

clark_yang 发表于 2021-3-29 12:01
跑IRC和过渡态是同一级别进行的，反应复合物和产物复合物同样也要在一个级别么？这个问题还真没注意，非 ...

不在同一级别怎么对比
内行审稿人不comment就怪了

作者
Author: clark_yang 时间: 2021-3-30 07:43

sobereva 发表于 2021-3-29 18:03
不在同一级别怎么对比
内行审稿人不comment就怪了

多谢，卢老师耐心解释！

作者
Author: Litzhu 时间: 2025-6-11 20:53
哈喽您好，对于您提问的过渡态跑IRC时出现非常规曲线这个博文，我也遇到类似情况；就是我在按照文献完全重复计算一个反应过渡态，文献中也给出两步基元反应（即存在TS1和TS2），存在一个中间体。但我计算时TS1找到和文献一样，跑IRC时，也会出现略平，最后就会直接到产物。我怎么也找不到和文献一样的中间体结构。第一步基元反应过程会涉及分子内电子结构转移过程，第二步反应很快。我想请问您对于你提的那个问题有解决吗？谢谢解答。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)