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标题: centos8系统下运行VASP出现的问题 [打印本页]

作者
Author: QH1995 时间: 2021-3-26 21:03
标题: centos8系统下运行VASP出现的问题
本帖最后由 QH1995 于 2021-3-26 21:07 编辑

求助大家：
我是centos8系统下的VASP6.1.2版本。intel编译器是parallel_studio_xe_2019_cluster_edition（之前装的是Intel_Parallel_Studio_XE_2019_Update版本，但是出现的问题一样，于是乎我就换成前面提到的这个）
我在运行mpirun -np 16 vasp之后，终端会提示这样的好几行，我也不知道是什么，上网查也没查出来个所以然，所以想请教诸位前辈，这是什么意思？
这样导致的结果就是计算在自己进行的时候就自动退出了。
在这里求助各位前辈了

作者
Author: abin 时间: 2021-3-26 21:48
重新申明编译器尤其是MKL MPI设定再看看。

作者
Author: QH1995 时间: 2021-3-26 22:13

abin 发表于 2021-3-26 21:48
重新申明编译器尤其是MKL MPI设定再看看。

你好，非常感谢回复哈。请问重新申明具体地是指什么呢？能不能详细说一下，我对centos系统下的环境编译不是很懂，非常感谢！

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-3-26 22:59

source /opt/intel/parallel_studio_xe_2019/bin/psxevars.sh intel64

复制代码

如果是安装在默认位置的话

作者
Author: QH1995 时间: 2021-3-26 23:01

喵星大佬发表于 2021-3-26 22:59
如果是安装在默认位置的话

意思是把原本环境变量中的这个intel64删除再创建一个新的吗？

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-3-26 23:02

QH1995 发表于 2021-3-26 23:01
意思是把原本环境变量中的这个intel64删除再创建一个新的吗？

重新申明编译器尤其是MKL MPI设定再看看

我说的是这个

作者
Author: QH1995 时间: 2021-3-26 23:08

喵星大佬发表于 2021-3-26 23:02
我说的是这个

好的，我大致明白意思了。就是在/etc/profile.d/intel.sh里加上这一行。可以这么理解吗？

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-3-26 23:12

QH1995 发表于 2021-3-26 23:08
好的，我大致明白意思了。就是在/etc/profile.d/intel.sh里加上这一行。可以这么理解吗？

建议不要写到系统全局里，用到再source或者在bash里source了运行完就结束

作者
Author: QH1995 时间: 2021-3-26 23:14

喵星大佬发表于 2021-3-26 23:12
建议不要写到系统全局里，用到再source或者在bash里source了运行完就结束

好的，明白了，谢谢你！我是尝试一下

作者
Author: QH1995 时间: 2021-3-27 13:27

喵星大佬发表于 2021-3-26 23:12
建议不要写到系统全局里，用到再source或者在bash里source了运行完就结束

你好，我按照昨天说的内容，首先把/etc/profile.d/intel.sh的内容清空了。
然后又vi ~/.bashrc
接下来把你说的source /opt/intel/parallel_studio_xe_2019/bin/psxevars.sh intel64 （我的路径就是默认的没错，在这个位置也能找到对应的文件）
可是我在新打开一个终端的时候，提示bash: /home/estar/intel/parallel_studio_xe_2019/bin/psxevars.sh: No such file and directory 请问这是什么情况呢？其中/home/estar是我的地址，但是这里面没有intel文件夹。我就想问intel不应该在/opt/里面吗，怎么跑到home/estar里了？
谢谢！

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