计算化学公社

标题: 求助,namd跑好的dcd轨迹文件转化为amber的crd文件的问题 [打印本页]

作者
Author:
yl233    时间: 2021-3-31 10:48
标题: 求助,namd跑好的dcd轨迹文件转化为amber的crd文件的问题
namd跑好的dcd轨迹文件在vmd中保存为amber的crd文件以后,怎么生成对应的prmtop文件来加载crd文件呢?我用tleap生成这个prmtop文件来加载这个crd文件,发现键的信息不对应,轨迹非常混乱。求求大家帮帮

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-3-31 12:29
ParmED可以转换拓扑文件
作者
Author:
yl233    时间: 2021-4-8 09:11
sobereva 发表于 2021-3-31 12:29
ParmED可以转换拓扑文件

好的好的,谢谢




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3