计算化学公社

标题: gromacs如何作膜距离为X轴的水密度分布图 [打印本页]

作者
Author: 王珑霏 时间: 2021-3-31 10:51
标题: gromacs如何作膜距离为X轴的水密度分布图
本帖最后由王珑霏于 2021-3-31 14:38 编辑

(, 下载次数 Times of downloads: 36) 像这种水密度与膜距离的图怎么画呢？gmx density 命令好像是不能画的
(, 下载次数 Times of downloads: 48) gmx density 的话是这样吗

作者
Author: Lacrimosa 时间: 2021-3-31 11:37
做个水的密度分布，再做个膜的密度分布，然后对照着两个图修改一下坐标轴就可以了

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-31 12:26
gmx density完全可以

作者
Author: 王珑霏 时间: 2021-3-31 14:22

Lacrimosa 发表于 2021-3-31 11:37
做个水的密度分布，再做个膜的密度分布，然后对照着两个图修改一下坐标轴就可以了

用gmx density吗

作者
Author: 王珑霏 时间: 2021-3-31 14:23

sobereva 发表于 2021-3-31 12:26
gmx density完全可以

用那个命令就可以吗？我试了几次都出不来

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-31 15:27

王珑霏发表于 2021-3-31 14:23
用那个命令就可以吗？我试了几次都出不来

是
用法不当。

作者
Author: 王珑霏 时间: 2021-3-31 15:37

sobereva 发表于 2021-3-31 15:27
是
用法不当。

是哪里有问题呢，希望老师能够指点一下，麻烦老师啦

作者
Author: 王珑霏 时间: 2021-3-31 16:27

sobereva 发表于 2021-3-31 15:27
是
用法不当。

盒子划分的不对吗

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)