计算化学公社

标题: 求助：模拟盒子中极性和非极性区域怎么画图 [打印本页]

作者
Author: txh 时间: 2021-3-31 16:27
标题: 求助：模拟盒子中极性和非极性区域怎么画图
请问，在模拟盒子中，怎么画出这种极性和非极性的区域。另外怎么能够得到.cube或.bqb文件（This requires volumetric electron density data in each step of the trajectory (.cube or .bqb).） (, 下载次数 Times of downloads: 42)

作者
Author: sobereva 时间: 2021-3-31 20:38
极性和非极性的定义是自己决定的。
在VMD里建立rep，分别用不同的语句选择极性和非极性部分（例如根据原子名选择），coloring method指定用不同颜色着色
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

作者
Author: txh 时间: 2021-4-1 13:36

sobereva 发表于 2021-3-31 20:38
极性和非极性的定义是自己决定的。
在VMD里建立rep，分别用不同的语句选择极性和非极性部分（例如根据原子 ...

懂了谢谢社长回复

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