计算化学公社

标题: 怎样用Gaussian进行煤分子与甲烷气体分子模拟吸附 [打印本页]

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-5 09:56
标题: 怎样用Gaussian进行煤分子与甲烷气体分子模拟吸附
在使用Gaussian时计算煤分子与甲烷气体分子吸附模拟遇到困难，怎样用高斯对煤分子结构片段与甲烷分子进行吸附模拟？
是简单的把两个分子结构放在一起就可以？还是需要进行优化？

在此感谢答复

作者
Author: exity 时间: 2021-4-5 11:11
煤分子能不能发出来看看？

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-5 14:03

exity 发表于 2021-4-5 11:11
煤分子能不能发出来看看？

去掉煤分子的立体层状结构，两个苯环构成的煤分子骨架上伸出一条含有1个C原子和1个N原子的侧链以及一条含有2个C原子的侧链

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-6 03:30
当然得优化复合物结构，手动直接摆的结构没有任何意义

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-6 08:08

sobereva 发表于 2021-4-6 03:30
当然得优化复合物结构，手动直接摆的结构没有任何意义

感谢sobereva老师的回复，是对分子片段进行opt几何优化的计算是嘛然后得到需要的电子能量数据

作者
Author: ABetaCarw 时间: 2021-4-6 10:15

exity 发表于 2021-4-5 11:11
煤分子能不能发出来看看？

这个问题我以前问过还真的能在文献中找到煤分子。当然煤肯定不是那样子的分子，但是既然有文献以XX分子作为煤分子后来人也就只能那样做了

作者
Author: exity 时间: 2021-4-6 10:28

ABetaCarw 发表于 2021-4-6 10:15
这个问题我以前问过还真的能在文献中找到煤分子。当然煤肯定不是那样子的分子，但是既然有文献以XX分子 ...

可能是简化抽象过的能体现煤的一些性质的分子吧。

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-6 14:31

ABetaCarw 发表于 2021-4-6 10:15
这个问题我以前问过还真的能在文献中找到煤分子。当然煤肯定不是那样子的分子，但是既然有文献以XX分子 ...

哈可能碰巧看到是同一篇文献

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-6 20:58

李总把头发表于 2021-4-6 08:08
感谢sobereva老师的回复，是对分子片段进行opt几何优化的计算是嘛然后得到需要的电子能量数据

我明明说的是“优化复合物结构”

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-6 21:44

sobereva 发表于 2021-4-6 20:58
我明明说的是“优化复合物结构”

好知道了我重新做下谢谢sob老师

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-7 09:49

sobereva 发表于 2021-4-6 20:58
我明明说的是“优化复合物结构”

sob老师我用DPT的B3LYP在6-311G（d)基组上可以用来优化复合物结构么

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-8 01:10

李总把头发表于 2021-4-7 09:49
sob老师我用DPT的B3LYP在6-311G（d)基组上可以用来优化复合物结构么

那是DFT
泛函问题仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557（http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html）
基组可以，如果涉及到氢键，改成6-311G**

作者
Author: 李总把头 时间: 2021-4-8 16:28

sobereva 发表于 2021-4-8 01:10
那是DFT
泛函问题仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的

好的感谢sob老师的回复和耐心指导

作者
Author: xylz6188 时间: 2021-5-17 07:27
现在都很少做这种片段了，都是做聚合物大分子，做分子模拟。具体你可以参照一下四川大学储伟课题组的文章，他们课题组周亚男、蒋倩、孙文晶等都做了类似的体系

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