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标题: 求助gmx insert-molecules命令中dat文件的编写规则 [打印本页]

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Author: TOPGAO 时间: 2021-4-6 17:04
标题: 求助gmx insert-molecules命令中dat文件的编写规则
我在做模拟教程的时候有这样一个步骤“通过将其坐标写入称为“ positions.dat”的文本文件中，在模拟框中指定肽质心的位置。将肽放在金层上方的盒子中间，距表面约2.7 nm。要写入文件的坐标为2.0、2.0和3.5。”但是文中没有给出具体的编写步骤。
请教dat文件的编写规则，或者这样的位置编写的例子文件，感激不尽

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Author: lyj714 时间: 2021-4-6 19:51
创建一个position.dat空文本文件，写上:

2.0 2.0 3.5

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Author: TOPGAO 时间: 2021-4-6 20:52

lyj714 发表于 2021-4-6 19:51
创建一个position.dat空文本文件，写上:

回车，保存！

可是还有指定质心位置，还有据表面2.7nm，这些怎么表示

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Author: sobereva 时间: 2021-4-7 00:40

TOPGAO 发表于 2021-4-6 20:52
可是还有指定质心位置，还有据表面2.7nm，这些怎么表示

基本的几何、坐标的关系中学生都会

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