计算化学公社

标题: 求助：请问gromacs可以计算液体的凝固点吗 [打印本页]

作者
Author: 邱美佳 时间: 2021-4-6 18:25
标题: 求助：请问gromacs可以计算液体的凝固点吗
请问gromacs可以计算液体的凝固点吗

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-7 00:38
可以

作者
Author: 邱美佳 时间: 2021-4-7 10:33

sobereva 发表于 2021-4-7 00:38
可以

请问卢老师，怎么计算凝固点呢？

作者
Author: sweetbotsu 时间: 2021-4-7 20:11

邱美佳发表于 2021-4-7 10:33
请问卢老师，怎么计算凝固点呢？

需要把能量温度曲线做出来之后用麦克斯韦等面积法则算吧，毕竟直接模拟会有热滞之类的现象，不管热滞的话做长时间的模拟退火？用Maxwell等面积法则算的话大概要用广义正则系综（GCE），我这有篇文献你可以看看，但是GCE怎么在GROMACS里实现我还不知道，只知道LAMMPS里有，我在想办法实现。
文献：Shao, M. Z., Wang, Y. T., & Zhou, X. (2020). Fast and accurate determination of phase transition temperature via individual generalized canonical ensemble simulation. Chinese Physics B, 29(8), 2–7.

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-8 01:09
不同温度下分别做模拟，看什么时候不再是液体（通过扩散系数可判断）

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