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标题: 利用54A7力场模拟蛋白配体复合物,No default Proper Dih. types [打印本页]

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沐雨书生    时间: 2021-4-10 08:05
标题: 利用54A7力场模拟蛋白配体复合物,No default Proper Dih. types
我用54A7力场模拟蛋白配体复合物,但是使用gromacs的grompp命令时报错

Generated 168 of the 1653 non-bonded parameter combinations
ERROR 1 [file topol_Protein_chain_A.itp, line 30133]:
  No default Proper Dih. types
ERROR 2 [file topol_Protein_chain_A.itp, line 30134]:
  No default Proper Dih. types
ERROR 3 [file topol_Protein_chain_A.itp, line 31494]:
  No default Proper Dih. types
ERROR 4 [file topol_Protein_chain_A.itp, line 31757]:
  No default Proper Dih. types
ERROR 5 [file topol_Protein_chain_A.itp, line 33184]:
  No default Proper Dih. types

请问这个如何解决?



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sobereva    时间: 2021-4-10 10:04
报错提示明确说的是itp文件,你没上传itp,别人也无从判断。
另外,你用的2021.1版非常新,不排除有bug的可能。如果你查不出毛病,也试试老版本

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沐雨书生    时间: 2021-4-10 10:41
sobereva 发表于 2021-4-10 10:04
报错提示明确说的是itp文件,你没上传itp,别人也无从判断。
另外,你用的2021.1版非常新,不排除有bug的 ...

老师,之前itp文件上传不了,现在压缩了一下

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panernie    时间: 2021-4-10 12:55
用2019.6版本吧,稳定又好用
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sobereva    时间: 2021-4-12 08:56
你去看报错上提示的itp里相应的行就知道,都没给参数
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ShineZhu    时间: 2023-4-28 10:24
您好,打扰请问一下您的这个问题后来是怎么解决的呀,我也是这个错误




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