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标题: 请问NAMD或者VMD有批量处理轨迹文件的脚本吗？ [打印本页]

作者
Author: 退休老干部 时间: 2021-4-10 14:42
标题: 请问NAMD或者VMD有批量处理轨迹文件的脚本吗？
比如我要研究配体从蛋白质解离的路径，run了上百条轨迹，我需要知道这几百条轨迹里，1）哪些是成功的（因为除了目标配体，还有Mg离子，还有其他配体存在，我想确定这些有没有被错误地解离出来）2）统计力的方向（最后输出文件里有输出力的方向），所以我想请问一下vmd或者namd有类似处理上述行为的tcl脚本吗？还是得自己写

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-11 02:20
对特殊体系的专一性的脚本一般都没有现成的，必须自己写。从技术上这种脚本没有什么难写的，几十行就能搞定

作者
Author: 退休老干部 时间: 2021-4-11 11:33

sobereva 发表于 2021-4-11 02:20
对特殊体系的专一性的脚本一般都没有现成的，必须自己写。从技术上这种脚本没有什么难写的，几十行就能搞定

好的，谢谢

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