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标题: 使用Multiwfn批量添加平面/非平面的点用于NICS计算 [打印本页]

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123qwertybobo    时间: 2021-4-10 23:36
标题: 使用Multiwfn批量添加平面/非平面的点用于NICS计算
本帖最后由 123qwertybobo 于 2021-4-10 23:36 编辑

如果看过http://sobereva.com/261这篇博文,你会发觉重复一遍是有些繁琐的。写一些shell是对科研有所助力的,但对想要进步的新手不那么友好。这就是本篇的初衷。
shell并不复杂,如果认真看过原博文,大概会知道shell中的意思。需要准备的是gjf文件以及lab文件。lab文件就是用于label plane的,比如Plane1.lab。特别注意lab文件是给Multiwfn用的,内容自然遵其原则,比如一个苯环,1-6。
gjf格式常用"空行/n0 1/n[molecular coordinate]/n/n“分割坐标。个人习惯把这部分摘出来再进行编辑,也就是tmp1。下一步就是产生面心存在tmp2里。再利用面心产生距离面+1和-1埃的Bq坐标放在tmp3里。Bq坐标再插入到tmp1的后面,再补充相应的命令即可。相应的gjf就存到了target文件里。使用:shell文件和gjf、lab文件放一起。执行一下就可以了。算完以后,依然可以批量实现NICS的输出,且听下回分解。






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