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标题: 求助怎样得到单个长链分子不同构型的能量变化 [打印本页]

作者
Author: IamHK 时间: 2021-4-12 12:29
标题: 求助怎样得到单个长链分子不同构型的能量变化
各位老师同学好。在一个液相体系，我想统计一个正庚烷分子跨膜运动时不同构型的能量变化，请问有什么方法？使用的软件是gromacs。
然后，我自己采取的措施是使用gmx energy -f .edr命令，选着了LJ-14 heptane-heptane 和LJ-SR heptane-heptane以及类似的Coul选项，但是即便正庚烷分子发生了较大形变，能量也不会有太大变化，这是正常的吗？谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-13 11:40
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