计算化学公社

标题: 表面模型过小，导致过渡态Reaction Preview的时候，一个原子跑到模型外 [打印本页]

作者
Author: 石头圭 时间: 2021-4-12 12:52
标题: 表面模型过小，导致过渡态Reaction Preview的时候，一个原子跑到模型外
本帖最后由石头圭于 2021-4-13 12:04 编辑

进行过渡态搜索的时候本来是想H和Cl结合的，结果因为平面有点小，H2中的一个H就跑到平面外去了，有没有什么办法可以解决

作者
Author: dfterok 时间: 2021-4-12 15:09
你认为模型有点小是基于什么理由，有没有尝试扩大？

作者
Author: 石头圭 时间: 2021-4-12 17:43

dfterok 发表于 2021-4-12 15:09
你认为模型有点小是基于什么理由，有没有尝试扩大？

之前建的表面模型有点小，优化都用的这个模型，重算比较麻烦，所以暂时不考虑扩大。就是看看有没有别的办法

作者
Author: Penson 时间: 2021-4-12 23:01
覆盖度？

作者
Author: 永远都要学会 时间: 2021-4-13 10:27
反应物和产物display style在original下原子都应该在晶胞内

作者
Author: 石头圭 时间: 2021-4-13 12:01

Penson 发表于 2021-4-12 23:01
覆盖度？

您说的覆盖度指的是？

作者
Author: 石头圭 时间: 2021-4-13 12:02

永远都要学会发表于 2021-4-13 10:27
反应物和产物display style在original下原子都应该在晶胞内

是在晶胞内，但是因为是周期性结构，reaction preview的时候，他就会连最近的，所以就连到上个周期去了

作者
Author: Penson 时间: 2021-4-13 14:36

石头圭发表于 2021-4-13 12:01
您说的覆盖度指的是？

就是你的气体分子在xy平面的面积是金属切面的面积的占比数

作者
Author: 石头圭 时间: 2021-4-25 18:46

永远都要学会发表于 2021-4-13 10:27
反应物和产物display style在original下原子都应该在晶胞内

in-cell是在晶胞内已解决

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)