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标题: 请问怎样提交脚本作业给超算 [打印本页]

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Author: zhi2679889405 时间: 2021-4-12 21:39
标题: 请问怎样提交脚本作业给超算
本帖最后由 zhi2679889405 于 2021-5-10 17:36 编辑

利用此脚本提交作业

#BSUB -q normal

#BSUB -n 40

#BSUB -R "span[ptile=20]"

#BSUB -cwd .

#BSUB -e %J.err

#BSUB -o %J.out

export g09root=/opt/

source $g09root/g09/bsd/g09.profile

export PATH=$g09root/g09:$PATH

export GAUSS_SCRDIR=/tmp

export GAUSS_LFLAGS="-opt 'Tsnet.Node.lindarsharg:ssh'"

#list host name

export GAUSS_WDEF="$(cat $LSB_DJOB_HOSTFILE|sort|uniq|awk '{ printf("%s,",$1) }' | sed 's/,$//')"

#specify SMP core number

export GAUSS_PDEF="20"

g09 < Au20tcnq-edge.com > Au20tcnq-edge.log

#BSUB -q default 队列

#BSUB -n 40 : 总核数

#BSUB -R "span[ptile=20]" : 每个节点核数

#BSUB -e %J.err : 标准错误流重定向文件，%J表示作业号

#BSUB -o %J.out : 标准输出重定向文件，%J表示作业号

export GAUSS_PDEF="20" : 每个节点核数，需span的值一致

Au20tcnq-edge.com : 高斯输入文件，只需要制定%check %mem, 不需要指定nprocs等

作业提交方式：

bsub < g90.sh

新手第一次使用，麻烦各位前辈了

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