计算化学公社

标题: 搜寻过渡态遭遇问题 [打印本页]

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Author: 发光 时间: 2021-4-16 10:14
标题: 搜寻过渡态遭遇问题
我在简单量化贴咨询过此问题，但是没有附图，讨论不太方便，因此在此重新发帖，望见谅。

针对图中B1和B2过渡态, 即双分子结合/直接脱氢反应。根据文献优化好反应物与反应物后，运用QST2搜索，针对此类反应总是出现报错：{反应物与产物结构差别过大，程序无法（迭代）产生过渡态初始猜测} ; 运用TS，直接初猜结构，跑IRC后发现又不能和反应物或生成物吻合。

如果说此反应不是基元反应，那么这个团队将其处理为基元反应的出发点是什么呢？希望能听听前辈们的意见

作者
Author: zjxitcc 时间: 2021-4-16 10:20
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-4-16 15:18 编辑

“跑IRC后发现又不能和反应物或生成物吻合”是个令人兴奋的发现，赶紧按照自己的思路把整条路径算完，看看文献里有没漏掉什么步骤。我是亲眼见过顶刊里算反应偷懒没跑IRC，结果一步关键步骤有个有意思的中间体，涉及到一个有意思的机理，后来被别人重算发现了（常规DFT计算，很容易重复），加实验后再扩展了一下拿去另发顶刊。

“这个团队将其处理为基元反应”有可能是他们没跑IRC，也有可能是他们的计算级别与你的不一样。

作者
Author: archer 时间: 2021-4-16 15:00

zjxitcc 发表于 2021-4-16 10:20
“跑IRC后发现又不能和反应物或生成物吻合”是个令人兴奋的发现，赶紧按照自己的思路把整条路径算完，看 ...

请问纯粹的反应路径计算能发到什么样的顶刊，JACS有希望吗？

作者
Author: zjxitcc 时间: 2021-4-16 15:17
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-4-16 15:50 编辑

archer 发表于 2021-4-16 15:00
请问纯粹的反应路径计算能发到什么样的顶刊，JACS有希望吗？

综合取决于该反应的重要性、有没有令人耳目一新的机理、是否（部分或全部）推翻了前人算过的机理、反应的复杂程度（过渡金属催化、手性、电催化、表界面、特殊环境下）等等等等。

PS：问我这种没发过JACS的人这种问题，我的回答可能也不具有实用性。。。

作者
Author: biogon 时间: 2021-4-18 10:42

archer 发表于 2021-4-16 15:00
请问纯粹的反应路径计算能发到什么样的顶刊，JACS有希望吗？

JACS发纯计算当然有的，甚至发nc都可以，不过这里面影响因素太多，你看看别人发的就大概懂了

作者
Author: 量化小菜鸡 时间: 2021-4-18 12:42

biogon 发表于 2021-4-18 10:42
JACS发纯计算当然有的，甚至发nc都可以，不过这里面影响因素太多，你看看别人发的就大概懂了

现在纯计算发JACS好难，Houk现在都基本是合作发的。

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