计算化学公社

标题: 求助：石墨烯表面吸附分子模型应该怎么搭建？ [打印本页]

作者
Author: gch123 时间: 2021-4-21 21:31
标题: 求助：石墨烯表面吸附分子模型应该怎么搭建？
请问一下各位老师，用gaussian计算石墨烯吸附(AlF6)3-离子时，石墨烯与吸附离子的相对大小应该怎么确定呢？6X6的石墨烯表面足够吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-21 21:50
边界的碳与(AlF6)3-的最近距离应当不小于8埃

作者
Author: gch123 时间: 2021-4-21 21:58

sobereva 发表于 2021-4-21 21:50
边界的碳与(AlF6)3-的最近距离应当不小于8埃

好的谢谢老师

作者
Author: gch123 时间: 2021-4-21 22:31
本帖最后由 gch123 于 2021-4-23 09:28 编辑

sobereva 发表于 2021-4-21 21:50
边界的碳与(AlF6)3-的最近距离应当不小于8埃

老师，我建好后发现矩形石墨烯层原子有260多个，会不会太多了，计算太费时间？不知道为什么上传不了图片了，不好直观显示我的模型

作者
Author: sobereva 时间: 2021-4-23 00:09

gch123 发表于 2021-4-21 22:31
老师，我建好后发现矩形石墨烯层原子有260多个，会不会太多了，计算太费时间？不知道为什么上传不了图片 ...

仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么贴图

260个不算多
再小一圈也不是不可以

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-4-25 01:53
你考虑的是掺杂的石墨烯吗？如果是pristine的石墨烯，不可能吸附的，真空里可以吸附，一考虑溶剂水，吸附自由能肯定是不利的，因为表面是疏水的，而高价离子很亲水。
如果石墨烯带正电荷，比如掺杂了一个氮然后带一个正电荷，那还有戏。但是这种石墨烯实验上不好做，你算出来很可能是屠龙术，算的好像能吸附，但是几乎不可能有人在实验上做出来。
从实用角度讲，不如算石墨烯-阳离子表面活性剂-(AlF6)3-三元体系，阳离子表面活性剂的亲水端捕捉(AlF6)3-，疏水端吸附在石墨烯上。

作者
Author: jiangning198511 时间: 2021-4-25 11:30

wzkchem5 发表于 2021-4-25 01:53
你考虑的是掺杂的石墨烯吗？如果是pristine的石墨烯，不可能吸附的，真空里可以吸附，一考虑溶剂水，吸附自 ...

掺杂了一个N后带一个正电荷，是说掺杂后N带正电荷，附件的C带负电荷，发生了电子转移，整体仍是电中性，这里不应该是表述为石墨烯带正电荷吧，石墨烯带正电荷意味着从石墨烯体系拿走一个电子

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-4-25 15:37

jiangning198511 发表于 2021-4-25 11:30
掺杂了一个N后带一个正电荷，是说掺杂后N带正电荷，附件的C带负电荷，发生了电子转移，整体仍是电中性， ...

正常石墨烯掺杂N是中性的。我指的是把石墨烯的一个C换成N，其他什么都不变，然后这个N带一个正电荷。这样理论上可以让石墨烯带一个正电荷，但是反正我没见过有人做出来过，你第一反应想得跟我不一样也印证了一般没有这种掺杂的石墨烯。。。

作者
Author: 壹零壹室掃地僧 时间: 2021-4-26 11:06

wzkchem5 发表于 2021-4-25 15:37
正常石墨烯掺杂N是中性的。我指的是把石墨烯的一个C换成N，其他什么都不变，然后这个N带一个正电荷。这样 ...

请教一下，怎么知道实验上制备的氮掺杂石墨烯带多少电荷呢?这个和计算中设置的带1个电荷如何对应起来？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-4-26 19:10

壹零壹室掃地僧发表于 2021-4-26 11:06
请教一下，怎么知道实验上制备的氮掺杂石墨烯带多少电荷呢?这个和计算中设置的带1个电荷如何对应起来？

查实验对于氮杂石墨烯的表征结果，每种氮分别有多大比例，然后画共振式确定每种氮的电荷

作者
Author: 壹零壹室掃地僧 时间: 2021-4-27 10:23

wzkchem5 发表于 2021-4-26 19:10
查实验对于氮杂石墨烯的表征结果，每种氮分别有多大比例，然后画共振式确定每种氮的电荷

我之前看很多文献，石墨化氮（1个氮直接替换1个碳）都是自旋多重度为2来处理的，认为有一对孤对电子没成键，整体带电还是为0。那这种结果和带1个正电的基态都有可能吧，计算时似乎可以取能量低的，实验上怎么证明是哪个是对的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-4-27 14:35

壹零壹室掃地僧发表于 2021-4-27 10:23
我之前看很多文献，石墨化氮（1个氮直接替换1个碳）都是自旋多重度为2来处理的，认为有一对孤对电子没成 ...

实验上带自由基的N和带正电荷的N应该可以从XPS区分开。而且这两者没法比较哪个能量更低，因为电子数不同。只能谈论在给定外电势下哪个能量更低。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)