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标题: 求助，reaxFF运行时总是自动生成CHO_example.trj，很占磁盘内存，请问如何避免？ [打印本页]

作者
Author: loading 时间: 2021-4-24 19:48
标题: 求助，reaxFF运行时总是自动生成CHO_example.trj，很占磁盘内存，请问如何避免？
我的reaxFF运行的in文件是根据lammps中的trj文件改的
运行时总是自动生成CHO_example.trj，这个文件很大，很占磁盘内存。想请问应该如何修改in文件才能避免生成这个文件？

in文件如下：
# REAX potential for CHO system
# .....

units       real
atom_style charge
read_data Polypf5Anneal.data

pair_style reax/c lmp_control
pair_coeff * * ffield.reax.cho  C H O

neighbor 2 bin
neigh_modify every 10 delay 0 check no

fix 1 all nvt temp 3500.0 3500.0 100.0
fix 2 all qeq/reax 1 0.0 10.0 1.0e-6 param.qeq
fix 4 all reax/c/species 1 100 100 species.out element C H O
velocity all create 3500 428459 dist gaussian

timestep 0.25
thermo  4000

dump       1 all atom 4000 3500nvt.lammpstrj
run       2000000

作者
Author: fineren 时间: 2021-4-25 09:05
lmp_control后面加NULL

作者
Author: 复前行79 时间: 2021-4-25 18:22
lmp_control文件里面的参数write_freq 可以更输出trj的频率，常用参数官方手册都有写。

作者
Author: loading 时间: 2021-8-9 15:38

复前行79 发表于 2021-4-25 18:22
lmp_control文件里面的参数write_freq 可以更输出trj的频率，常用参数官方手册都有写。

谢谢！用这个方法解决了

作者
Author: xinxinup 时间: 2021-9-6 09:30
请问用VMD可以打开CHO_example.trj吗，CHO_example.trj是什么格式的轨迹文件？

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-9-6 10:52

xinxinup 发表于 2021-9-6 09:30
请问用VMD可以打开CHO_example.trj吗，CHO_example.trj是什么格式的轨迹文件？

改.trj后缀为.xyz试试

作者
Author: xinxinup 时间: 2021-9-15 16:53

hdhxx123 发表于 2021-9-6 10:52
改.trj后缀为.xyz试试

换成.xyz的还是不行，从CHO_example.trj这个输出文件能获得什么信息呢？

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-9-15 23:37

xinxinup 发表于 2021-9-15 16:53
换成.xyz的还是不行，从CHO_example.trj这个输出文件能获得什么信息呢？

轨迹信息，如果不可以可能是输出的信息不规范或者是VMD安装的问题，改成.xyz应该是可以直接拖到VMD的main窗口载入的

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