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标题: 过渡态用小基组找到了,换成大基组就不行了 [打印本页]

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此时此夜    时间: 2021-4-27 16:48
标题: 过渡态用小基组找到了,换成大基组就不行了
如题,请教各位前辈,我在寻找一个脱水反应的过渡态时,先是用b3lyp/6-31g**找到了过度态,并且走irc联通了反应物和产物,但是在用m062x/6-311g**继续优化小基组找到的过渡态时,却走偏了,我尝试采用了opt(TS,calcall,noeigen,maxstep=5)关键词,但最终还是出错,请问这种情况该怎么办? 是否可以采用小基组找到的过渡态作为之后计算能量结构?

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snljty    时间: 2021-4-27 16:53
B3LYP又不加D3。
加了D3后没必要切换泛函继续优化。
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此时此夜    时间: 2021-4-27 17:26
snljty 发表于 2021-4-27 16:53
B3LYP又不加D3。
加了D3后没必要切换泛函继续优化。

好的 那我以后是否可以使用M062x/6-31g**来预先优化一下过渡态,之后再改为6-311g**继续优化 或者直接采用小基组得到的结构来计算能量?
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喵星大佬    时间: 2021-4-27 17:32
此时此夜 发表于 2021-4-27 17:26
好的 那我以后是否可以使用M062x/6-31g**来预先优化一下过渡态,之后再改为6-311g**继续优化 或者直接采 ...

优化别用m062x,尤其是找过渡态,算单点倒是不错
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此时此夜    时间: 2021-4-27 18:01
喵星大佬 发表于 2021-4-27 17:32
优化别用m062x,尤其是找过渡态,算单点倒是不错

好的 因为我见网上提到过 对于有机分子机构优化采用m062x会好一点 那对于有机体系过渡态的寻找有没有什么推荐的泛函?
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喵星大佬    时间: 2021-4-27 18:24
此时此夜 发表于 2021-4-27 18:01
好的 因为我见网上提到过 对于有机分子机构优化采用m062x会好一点 那对于有机体系过渡态的寻找有没有什么 ...

pbe0-d3(bj),b3lyp-d3(bj),mn15-d3(bj)
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喵星大佬    时间: 2021-4-27 18:25
此时此夜 发表于 2021-4-27 18:01
好的 因为我见网上提到过 对于有机分子机构优化采用m062x会好一点 那对于有机体系过渡态的寻找有没有什么 ...

pbe0-d3(bj),b3lyp-d3(bj),mn15-d3(bj)
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喵星大佬    时间: 2021-4-27 18:28
此时此夜 发表于 2021-4-27 18:01
好的 因为我见网上提到过 对于有机分子机构优化采用m062x会好一点 那对于有机体系过渡态的寻找有没有什么 ...

pbe0-d3(bj),b3lyp-d3(bj),mn15-d3(bj)
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此时此夜    时间: 2021-4-27 18:28
喵星大佬 发表于 2021-4-27 18:28
pbe0-d3(bj),b3lyp-d3(bj),mn15-d3(bj)

好的 谢谢
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fffff    时间: 2021-4-27 20:09
此时此夜 发表于 2021-4-27 18:01
好的 因为我见网上提到过 对于有机分子机构优化采用m062x会好一点 那对于有机体系过渡态的寻找有没有什么 ...

别全信文献,有机分子除了含过渡金属体系、大共轭体系,其他大部分用B3LYP-D3(BJ)就行了。M06-2X一般算能量。
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此时此夜    时间: 2021-4-27 20:37
fffff 发表于 2021-4-27 20:09
别全信文献,有机分子除了含过渡金属体系、大共轭体系,其他大部分用B3LYP-D3(BJ)就行了。M06-2X一般算能 ...

好的 谢谢
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sobereva    时间: 2021-4-28 00:06
M06-2X优化过渡态绝对不是不能用,而且比B3LYP-D3(BJ)找有机体系过渡态更可靠。只不过由于耗时比B3LYP-D3(BJ)高,而且对积分格点要求高(有时导致几何优化收敛更费劲、出现微小的虚假的虚频),所以B3LYP-D3(BJ)够用的话不考虑M06-2X。这在下文说了
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

在切换级别并进行对比的时候,绝对不要一次变两个,否则都无法确定到底是哪个因素带来的差异。

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此时此夜    时间: 2021-4-28 10:15
sobereva 发表于 2021-4-28 00:06
M06-2X优化过渡态绝对不是不能用,而且比B3LYP-D3(BJ)找有机体系过渡态更可靠。只不过由于耗时比B3LYP-D3(B ...

好的 谢谢老师
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lw198    时间: 2021-5-1 04:49
小基组和大基组找到的过渡态很大可能是结构不一样的,因为我之前用小基组找到了一部分过渡态,换成大基组之后一个都不对,又重新全部重做的。。。结果出来确实不一样,而且别说小基组了,即使你多加一个色散力(em=gd3) 做出来的结构都不一样,而且可能差的比较多。。除非你用小基组找到过渡态之后直接用大基组算单点能,在用大基组做比较难的情况下可以这么搞,读取小基组的correction和大基组单点能加起来就差不多是那个能量了。
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喵星大佬    时间: 2021-5-1 12:47
lw198 发表于 2021-5-1 04:49
小基组和大基组找到的过渡态很大可能是结构不一样的,因为我之前用小基组找到了一部分过渡态,换成大基组之 ...

对于的很多稍微大一点的结构,加不加DFT-D的影响比基组大得多,而且不加DFT-D很多时候结果是定性错误的
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lw198    时间: 2021-5-1 18:43
喵星大佬 发表于 2021-5-1 12:47
对于的很多稍微大一点的结构,加不加DFT-D的影响比基组大得多,而且不加DFT-D很多时候结果是定性错误的

哦哦好的,改大基组确实我用之前的结构也很多做不了(尤其是TS)
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xiayue    时间: 2025-7-25 13:36
想请教一下,大基组找的过渡态和小基组完全不一样,重新找的时候是用小基组找还是直接用大基组找呀




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