计算化学公社

标题: Multiwfn显示的NLMO轨道为什么和gaussview不同？ [打印本页]
作者
Author: 星斗如盘    时间: 2021-4-28 12:05
标题: Multiwfn显示的NLMO轨道为什么和gaussview不同？
本帖最后由 星斗如盘 于 2021-4-28 15:50 编辑

使用Multiwfn和gaussview分别分析苯分子的定域化分子轨道NLMO，可以看到Multiwfn显示的定域化的NLMO轨道分布在三个碳原子上，而gaussview显示的分布在四个碳原子上
作者
Author: zjxitcc    时间: 2021-4-28 13:12
isovalue不一样，左图是0.05，右图是0.02。你得都调成一样的数值才能比
作者
Author: 星斗如盘    时间: 2021-4-28 15:46
本帖最后由 星斗如盘 于 2021-4-28 15:49 编辑
zjxitcc 发表于 2021-4-28 13:12
isovalue不一样，左图是0.05，右图是0.02。你得都调成一样的数值才能比

和等值面没有关系
作者
Author: zjxitcc    时间: 2021-4-28 16:59
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-4-28 17:00 编辑
星斗如盘 发表于 2021-4-28 15:46
和等值面没有关系

用Multiwfn打开Ph-nlmo.fch文件（然后调isovalue=0.02）显示得与GV看起来没两样啊。你左图怎么来的，别是操作错了。我看目前Multiwfn自身不支持产生NLMO，你别是把其他轨道当成NLMO了。
作者
Author: 星斗如盘    时间: 2021-4-28 20:23
zjxitcc 发表于 2021-4-28 16:59
用Multiwfn打开Ph-nlmo.fch文件（然后调isovalue=0.02）显示得与GV看起来没两样啊。你左图怎么来的，别是 ...

左图，先对分子轨道定域化处理，后查看
作者
Author: zjxitcc    时间: 2021-4-28 21:58
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-4-28 22:04 编辑
星斗如盘 发表于 2021-4-28 20:23
左图，先对分子轨道定域化处理，后查看

你这说的也太简略了连具体步骤都没有（什么功能哪个数字，我知道是定域化，但是你不给出操作步骤，我不能认为你的操作是正确的），神仙也帮不了你。“对分子轨道定域化处理”你是做的NLMO么？别是拿PM局域化轨道去跟NLMO轨道对比啊，能自己说说到底做的是哪种局域轨道么（你能回答这个问题，估计也就自己找到答案了）。

我看Multiwfn目前不能从正则轨道生成NLMO，你大概率是弄成了别的局域轨道了（例如PM局域轨道），而不同的局域轨道略有区别 是必然的
作者
Author: 星斗如盘    时间: 2021-4-28 23:49
本帖最后由 星斗如盘 于 2021-4-28 23:50 编辑
zjxitcc 发表于 2021-4-28 21:58
你这说的也太简略了连具体步骤都没有（什么功能哪个数字，我知道是定域化，但是你不给出操作步骤，我 ...

不好意思，我说的不够清晰，我是使用Multiwfn默认的方法，输入19 1然后查看轨道，我又仔细看了一下，确实是用默认的PM局域化轨道，我以为PM局域化方法就是Multiwfn计算NLMO的方法呢
作者
Author: wzkchem5    时间: 2021-4-29 00:25
星斗如盘 发表于 2021-4-28 23:49
不好意思，我说的不够清晰，我是使用Multiwfn默认的方法，输入19 1然后查看轨道，我又仔细看了一下，确实 ...

PM是Pipek-Mezey，NLMO是natural localized molecular orbital，两者完全不是一个东西，也并不存在一个是计算另一个的方法
作者
Author: sobereva    时间: 2021-4-29 02:12
星斗如盘 发表于 2021-4-28 23:49
不好意思，我说的不够清晰，我是使用Multiwfn默认的方法，输入19 1然后查看轨道，我又仔细看了一下，确实 ...

帖子里明确说了区别
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380（http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html）
轨道定域化有许多做法。比较知名的是
(1)Edmiston-Ruedenberg定域化：1963年提出。通过最大化轨道的自互斥能（亦即最小化轨道间的互斥能）来实现定域化。缺点是耗时很高，而且得算复杂的双电子积分，而且又没额外好处，故很不推荐。
(2)Boys定域化：1960年提出。应用比较广泛，通过最小化轨道涵盖的空间范围来定域化。需要利用偶极矩积分。
(3)Pipek-Mezey定域化：1989年提出，它通过最大化Mulliken原子布居数的平方和达到定域化目的，编程实现颇为简单，只需要重叠积分，而且耗时很低，被广泛使用。后来还有人提出基于其它布居分析方法来做Pipek-Mezey定域化。
(4)NLMO定域化：NLMO的N是Natural的意思。这是NBO开发者提出的定域化方法，它将高占据(Lewis型)的NBO和低占据(non-Lewis型)的NBO以一定方式混合，从而得到整数占据的定域化轨道。由于得到NLMO轨道得先产生NBO，故此方法只有NBO程序，以及也同样能做NBO分析的Molpro才支持。
以上方法计算过程需要迭代，迭代过程中不同轨道间不断混合，最后使得目标函数被最大化或最小化。




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