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标题: Mxene和碳纳米管如何建模?用什么软件 [打印本页]

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雪见容馥    时间: 2021-4-29 10:58
标题: Mxene和碳纳米管如何建模?用什么软件
想构建下图的模型,由Mxene的Ti3C2和碳纳米管组成,有-O、-OH、-F官能团随机分布在表面,向各位大佬请教以下问题:
1、如何构建这个模型,用什么软件比较合适?2、对于此体系,计算吸附能结合能弱相互作用之类的,gaussian能否算的动?选用什么方法和基组比较合适?

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jiangning198511    时间: 2021-4-29 11:21
孤立体系的话 用gaussview, 如果是周期性的话 MS好一些
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雪见容馥    时间: 2021-4-29 12:12
jiangning198511 发表于 2021-4-29 11:21
孤立体系的话 用gaussview, 如果是周期性的话 MS好一些

用gaussview的话Ti3C2和碳纳米管要怎么画?导入外部的cif文件吗?

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喵星大佬    时间: 2021-4-29 12:20
管子用nanotubemodeler,简单得很
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雪见容馥    时间: 2021-4-29 15:07
喵星大佬 发表于 2021-4-29 12:20
管子用nanotubemodeler,简单得很

我看那个只能生成C-C单键的
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喵星大佬    时间: 2021-4-29 15:10
雪见容馥 发表于 2021-4-29 15:07
我看那个只能生成C-C单键的

然后是随便找个软件,不管是GV还是MS都可以,把原子替换了不就好了。。。。
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sobereva    时间: 2021-4-29 16:00
雪见容馥 发表于 2021-4-29 15:07
我看那个只能生成C-C单键的

量化计算完全无视你设的键,只看坐标

nanotube modeler又免费又易用,上面的官能团之后你用gview手动画上去就完了

这种大小体系Gaussian用DFT优化起来会极为费劲。要求不高的话可以xtb优化,然后ORCA算单点,这样最划算。Gaussian算单点也可以,但性价比低得多。
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雪见容馥    时间: 2021-4-29 20:04
喵星大佬 发表于 2021-4-29 15:10
然后是随便找个软件,不管是GV还是MS都可以,把原子替换了不就好了。。。。

好的,明白了
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雪见容馥    时间: 2021-4-29 20:05
sobereva 发表于 2021-4-29 16:00
量化计算完全无视你设的键,只看坐标

nanotube modeler又免费又易用,上面的官能团之后你用gview手动 ...

了解了,谢谢社长
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ymeng    时间: 2021-5-10 15:29
想求一下这篇文献可以吗?
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雪见容馥    时间: 2021-5-11 09:09
ymeng 发表于 2021-5-10 15:29
想求一下这篇文献可以吗?

这不是文献,是我们自己的课题
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ymeng    时间: 2021-5-11 14:43
雪见容馥 发表于 2021-5-11 09:09
这不是文献,是我们自己的课题

嗦嘎,我们最近也在做mxene




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