计算化学公社

标题: 求助：MS导出的pdb文件无法识别 [打印本页]

作者
Author: cheviax 时间: 2021-5-2 20:08
标题: 求助：MS导出的pdb文件无法识别
用MS导出的pdb文件使用 pdb2gmx指令时报错
Residue 'MOL' not found in residue topology database
不知道gromacs对pdb文件具体有什么要求？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-2 22:32
跟M$没有任何直接关系
pdb2gmx载入pdb，必须里面每个残基在rtp文件里都有相应的定义才能产生拓扑文件。搞清楚pdb2gmx的运行机制

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