计算化学公社

标题: gmx spatial生成的cube文件太大，怎么办？ [打印本页]

作者
Author: atomhong 时间: 2021-5-2 23:41
标题: gmx spatial生成的cube文件太大，怎么办？
想分析分子的sdf，然后用gmx spatial生成了cube文件，发现太大了，足足有28g，vmd一打开就崩溃，想问问大家有什么办法吗？我这边用的是-bin 0.01，生成了28g的文件，如果用-bin 0.05 生成的文件也有1g左右，而且sdf也不是很光滑，有什么解决办法吗？
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作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-2 23:49
用VMD自带的volmap插件产生空间分布函数。由于会用高斯函数平滑化，格点间较大也照样能得到较平滑的图像

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