计算化学公社

标题: MSD计算扩散系数拟合区间求助 [打印本页]

作者
Author: 土拔鼠 时间: 2021-5-3 22:14
标题: MSD计算扩散系数拟合区间求助
请教一下大家我在计算一个混合溶液体系其中一种溶剂的扩散常数我看培训的讲义里说MSD需要取一个相对平直的区域我做出的msd如下图不是很平直

我是否可以取110 ns——180 ns的区域这样做是否容易被审稿人质疑有没有权威一点的文章可以引用谢谢

作者
Author: k64_cc 时间: 2021-5-4 14:06
我觉得你还是先研究研究为什么不直为好。

作者
Author: 土拔鼠 时间: 2021-5-4 16:00

k64_cc 发表于 2021-5-4 14:06
我觉得你还是先研究研究为什么不直为好。

你好我第一次算这个MSD 是审稿人要求我加的我的体系是由A B两种溶剂组成的 AB不互溶 A和B的摩尔比是1：10 我算的是A的MSD 我现也在不太清楚我该怎么解释这个MSD的曲线也不太清楚应该取哪一段去算扩散系数我看20 ns—100 ns和100 ns—180 ns都是相对平整的因为是混合体系也没有实验值可以借鉴

作者
Author: xylz6188 时间: 2021-5-4 18:43
把除扩散溶剂以外的溶液固定试试

作者
Author: k64_cc 时间: 2021-5-4 19:19

土拔鼠发表于 2021-5-4 16:00
你好我第一次算这个MSD 是审稿人要求我加的我的体系是由A B两种溶剂组成的 AB不互溶 A和B的摩尔比是1： ...

你得知道你算的分子的扩散是在什么时间尺度下的。另外，MSD计算中，delta t越大，数据越少，曲线越不准。经验上看，用来拟合的区间最好别超过轨迹总长度的1/2，。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-5 00:16
可以从100ns作为MSD曲线的计算起点看看MSD曲线是什么样

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)