计算化学公社

标题: Countdown to ORCA 5.0 [打印本页]

作者
Author: wuy069 时间: 2021-5-4 15:38
标题: Countdown to ORCA 5.0
转发：Countdown to ORCA 5.0 - ORCA Forum (mpg.de)
Dear ORCA community,

I am happy to announce that all developers are now putting last touches on their respective codes. This means that we can soon start the countdown to the release of ORCA 5.0

We will proceed as follows:

1) We will make sure that our internal test suite (consisting of approximately 1500 jobs) runs through with essentially no remaining errors (we are at about 1% today).

2) After this is accomplished, we will "freeze" the code, e.g. close the repository for further changes and replace our own production version with the new code to test-drive it for a bit under real-life conditions.

3) Once this version is stable to our satisfaction, we will generate a final set of benchmark data and then release to the general public shortly after.

4) We plan to do an Online event for the release. The details have to be worked out - so stay tuned - There will be an announcement here in the forum!

Thank you all for your patience and support! It is a pleasure doing development knowing that there is a large, very fast growing, active and supportive user community.

Best wishes and stay safe!
Frank Neese

作者
Author: ms860309 时间: 2021-5-4 17:05
太好了終於要發布了
我記得之前看到有人提會改進算 hessian速度以及算cosx的準確度
另外如果能夠改 openmp就好了記憶體管理比較好

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-4 17:19

ms860309 发表于 2021-5-4 10:05
太好了終於要發布了
我記得之前看到有人提會改進算 hessian速度以及算cosx的準確度
另外如果能夠改 o ...

openmp可预见的未来不可能，改动的地方太多了

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-5-4 18:05

wzkchem5 发表于 2021-5-4 17:19
openmp可预见的未来不可能，改动的地方太多了

高斯电荷溶剂模型有hessian嘛

作者
Author: wuzhiyi 时间: 2021-5-4 18:15
等R2-scan-3c出来了，B97-3c就要滚下历史舞台了。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-4 23:52

wuzhiyi 发表于 2021-5-4 18:15
等R2-scan-3c出来了，B97-3c就要滚下历史舞台了。

耗时是B97-3c的两倍
优化目的B97-3c还是有用武之地的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-4 23:53

喵星大佬发表于 2021-5-4 11:05
高斯电荷溶剂模型有hessian嘛

有的

作者
Author: exity 时间: 2021-5-5 09:33
TDDFT溶剂耦合不知道这次能不能用了？

作者
Author: biogon 时间: 2021-5-5 16:12

wzkchem5 发表于 2021-5-4 17:19
openmp可预见的未来不可能，改动的地方太多了

neese之前说是已经有部分代码是openmp并行了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-5 19:39

exity 发表于 2021-5-5 02:33
TDDFT溶剂耦合不知道这次能不能用了？

什么叫溶剂耦合？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-5 19:40

biogon 发表于 2021-5-5 09:12
neese之前说是已经有部分代码是openmp并行了

有些比较独立的子程序，尤其是Grimme组做的程序，确实是openmp并行的。我只是想说把已经MPI并行过的代码改成openmp，尤其是大规模修改，不太现实

作者
Author: biogon 时间: 2021-5-5 19:44

wzkchem5 发表于 2021-5-5 19:40
有些比较独立的子程序，尤其是Grimme组做的程序，确实是openmp并行的。我只是想说把已经MPI并行过的代码 ...

mpi并行的能改成混合并行么？
另外orca里的block居然是串行的，用过一次才发现的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-5 19:47

biogon 发表于 2021-5-5 12:44
mpi并行的能改成混合并行么？
另外orca里的block居然是串行的，用过一次才发现的

理论上可以，但是不知道工作量大不大，以及对程序在各个平台上的兼容性影响大不大。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-5-5 20:03

wzkchem5 发表于 2021-5-4 23:53
有的

不知道对虚频情况有木有改进，现在来看优化是真的拉胯

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-5 20:07

喵星大佬发表于 2021-5-5 13:03
不知道对虚频情况有木有改进，现在来看优化是真的拉胯

理论上肯定有改进。ORCA 5.0默认的格点也比以前大，我们这边有人测过，用现在的默认格点，几百个中等大小的分子，只有一个假虚频。不过溶剂模型导致的假虚频我不知道有没有测过

作者
Author: exity 时间: 2021-5-6 13:04

wzkchem5 发表于 2021-5-5 19:39
什么叫溶剂耦合？

现在的ORCA里不管换什么溶剂，TDDFT结果都差不多。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-6 20:17

exity 发表于 2021-5-6 06:04
现在的ORCA里不管换什么溶剂，TDDFT结果都差不多。

你设定了折射率了吗？
如果不设定，orca默认溶剂折射率是1，导致低估溶剂对激发态的影响。这个很容易让人掉坑里去，但是为了backward compatibility，现在也不好改了。

作者
Author: biogon 时间: 2021-5-6 20:28

wzkchem5 发表于 2021-5-6 20:17
你设定了折射率了吗？
如果不设定，orca默认溶剂折射率是1，导致低估溶剂对激发态的影响。这个很容易让 ...

原来是因为这个，很早就发现tddft用溶剂模型有这个bug了
印象中去年的orca meeting neese说了要改这个问题来着？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-6 21:53

biogon 发表于 2021-5-6 13:28
原来是因为这个，很早就发现tddft用溶剂模型有这个bug了
印象中去年的orca meeting neese说了要改这个问 ...

不确定orca 5.0会不会改这个

作者
Author: exity 时间: 2021-5-7 08:03
本帖最后由 exity 于 2021-5-7 08:08 编辑

wzkchem5 发表于 2021-5-6 20:17
你设定了折射率了吗？
如果不设定，orca默认溶剂折射率是1，导致低估溶剂对激发态的影响。这个很容易让 ...

这个还真没有，回头试一试。去查了一下手册，还真有提这个事情，谢谢哈，学到了。
(, 下载次数 Times of downloads: 65)

作者
Author: 冰释之川 时间: 2021-5-7 08:15

exity 发表于 2021-5-7 08:03
这个还真没有，回头试一试。去查了一下手册，还真有提这个事情，谢谢哈，学到了。

我去。。。这意思是还得手动输入溶剂的折射率才能正确计算溶剂下的激发能？

作者
Author: exity 时间: 2021-5-7 09:17

冰释之川发表于 2021-5-7 08:15
我去。。。这意思是还得手动输入溶剂的折射率才能正确计算溶剂下的激发能？

貌似是的
如果不自定义我看了下CPCM里的折射率确实是1，不管你用什么溶剂。
现在在测试中。

作者
Author: 冰释之川 时间: 2021-5-7 09:56

exity 发表于 2021-5-7 09:17
貌似是的
如果不自定义我看了下CPCM里的折射率确实是1，不管你用什么溶剂。
现在在测试中。

我听大师说ORCA在算溶剂下的TDDFT任务时，漏考虑了一项好像。。。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-5-7 09:57

exity 发表于 2021-5-7 09:17
貌似是的
如果不自定义我看了下CPCM里的折射率确实是1，不管你用什么溶剂。
现在在测试中。

算激发态不是要设置动态折射率和静态折射率两个值嘛

作者
Author: exity 时间: 2021-5-7 10:07

喵星大佬发表于 2021-5-7 09:57
算激发态不是要设置动态折射率和静态折射率两个值嘛

暂时只查到了一个Refrac关键词，貌似是静态折射率。
再研究研究

作者
Author: exity 时间: 2021-5-7 10:13

喵星大佬发表于 2021-5-7 09:57
算激发态不是要设置动态折射率和静态折射率两个值嘛

大佬知道这两个关键词是啥吗？

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-5-7 14:17

exity 发表于 2021-5-7 10:13
大佬知道这两个关键词是啥吗？

%cpcm
epsilon Number
refrac Number
end

复制代码

一般溶剂模型是这个，不知道TD是不是，上面的number里写具体数值

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-7 15:28

exity 发表于 2021-5-7 03:07
暂时只查到了一个Refrac关键词，貌似是静态折射率。
再研究研究

这是动态折射率
静态折射率是从epsilon算出来的

作者
Author: exity 时间: 2021-5-7 17:01

wzkchem5 发表于 2021-5-7 15:28
这是动态折射率
静态折射率是从epsilon算出来的

能说一下怎么算的不？

作者
Author: hdhxx123 时间: 2021-5-7 17:14

exity 发表于 2021-5-7 17:01
能说一下怎么算的不？

http://sobereva.com/327

epsinf 一般查不到，可以用折射率的平方估算，折射率比较好查。如果连折射率也没有，那么对于非极性溶剂，可以假定 epsinf 的数值等于 eps；对于极性溶剂，epsinf 可以姑且设 1.9（各种溶剂的 epsinf 都在这附近）。

所以折射率可以用epsinf的根号估算？

作者
Author: exity 时间: 2021-5-7 17:19

hdhxx123 发表于 2021-5-7 17:14
http://sobereva.com/327

所以折射率可以用epsinf的根号估算？

many thx

作者
Author: ms860309 时间: 2021-5-12 23:36
轉Frank最新回覆

(, 下载次数 Times of downloads: 61)

作者
Author: wuzhiyi 时间: 2021-6-2 22:38
(, 下载次数 Times of downloads: 57)

作者
Author: jiangning198511 时间: 2021-6-18 15:35

wuzhiyi 发表于 2021-6-2 22:38

这个时间点不错

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-19 18:41

wuzhiyi 发表于 2021-6-2 15:38

更新：ORCA 5发布会的具体安排
7.1 北京时间晚11点开始， 7.2 北京时间下午3点开始
无需注册，但会议有人数限制，先到先得

原文：https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=7362&start=50

Dear ORCA Users - for the release of ORCA 5.0 there will be a webinar with an introduction by F. Neese, presentations by the authors and plenty of room for discussions and questions. The webinar will be hosted in ZOOM and will take place on the 1st and 2nd of July with an introductory talk in the evening of the 1st and scientific talks on the 2nd of July.

Here are the ZOOM links for the two days :

ORCA 5.0 Release Webinar Grand Opening
Time: Jul 1, 2021 opens 04:30 PM Amsterdam, Berlin, Rome, Stockholm, Vienna - starts at 5 pm
Join Zoom Meeting:
https://us02web.zoom.us/j/87800425716?pwd=dWhIcGFZQ05pNDBEVXlXVHRvYjFRUT09

ORCA 5.0 Release Webinar
Time: Jul 2, 2021 opens 08:30 AM Amsterdam, Berlin, Rome, Stockholm, Vienna - starts at 9 am
Join Zoom Meeting:
https://us02web.zoom.us/j/89314236320?pwd=WGJaRHFsRGdFUUFrdkZPOW9EczhiUT09

Note that you don't need to register and the meeting is free of charge, the only restriction is that we have a max
of 300 participants, so be quick ;-)

Looking forward to seeing many of you at the meeting !
A. A. Auer
www.kofo.mpg.de

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-29 22:43

wzkchem5 发表于 2021-6-19 11:41
更新：ORCA 5发布会的具体安排
7.1 北京时间晚11点开始， 7.2 北京时间下午3点开始
无需注册，但会议有 ...

更新：ORCA 5.0发布会期间在线讨论链接

Hello ORCA Users,

In order to participate in the ORCA 5.0 Release Event on July 1-2 in a more active manner, there will be live-chats accompanying the different talks on Rocket.Chat. Rocket.Chat is a chat platform, which offers much more flexibility than the internal Zoom chat.

To join, you must:
1) Register for a free account at https://www.gwdg.de/registration
2) Click the following invitation link: https://chat.gwdg.de/invite/P3XoDq (valid until July 13 2021)

This will give you access to the "orca-release-event" Channel.

Within the main Channel, there are "Discussions" for each of the talks in the program. This is where you can ask questions for the speaker to answer. Some questions will be chosen by the session moderator and answered live on Zoom. Others will be answered in the RocketChat. After the meeting, a summary of the most useful discussions will be posted on the ORCA forum.

Please use the "Reply" button to form conversation "Threads" and keep the chat rooms organized. For broader discussion topics, you can also create new Discussions ("+" button) within the main channel or any existing Discussion room.

You can find the existing Threads and Discussions using the "speech bubble" buttons at the top right.

More documentation of the features of RocketChat can be found at https://docs.rocket.chat/guides/user-guides
Native RocketChat clients for all major OSs are available at https://rocket.chat/install/ but the browser-based interface is also fully functional.

See you soon!

The ORCA Team

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)